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uibcdf/Sabueso

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Sabueso

Busqueda de información de blancos, ligandos, pdbs, etc.

Vamos a empezar con la información de blancos (proteínas) que necesitaran el código uniprot para sacar todo.

  • Interacciones protein-proteina: - Interfases - protein con las que forma complejo - Posible structura terciaria y cuaternaria
  • La lista de ligandos reportados: - información de inhibición, reglas lipinski, propiedades físicas, etc.. - posiblidad de sacar analogos del conjunto de ligandos reportados - que pudieran sacar farmacóforos de estos ligandos - que estos farmacóforos puedan cribar quimiotecas
  • Ruta metabólica o porcesos metabolicos en los que está implicado

MolInterrogator is the python wrapper or platform to get information of a given target from databases and servers. This information should be realted with:

  • Set of reported compounds: IC50, Binding affinity, etc.
  • Set of Protein-Protein interactions.
  • ...

Proteins (Targets)

Identificados con el código uniprot.

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Project based on the Computational Molecular Science Python Cookiecutter version 1.5.