flux analysis graph

@Titodinelli  la flux analysis si era rotta; per fixarla ho cancellato delle righe di codice e fixato una call che sembravano un residuo di qualcos'altro. puoi controllare?
Poi non funziona più networkx per i plot, se faccio display me li mostra, ma mi da errore quando cerco di filtrare per lista di specie (vedi notebook di esempio)