Datensatzdokumentation
Robert Koch-Institut | RKI
Nordufer 20
13353 Berlin
Fachgebiet 25 | Körperliche Gesundheit
Hannelore Neuhauser (Projektleitung)
Christina Poethko-Müller
Giselle Sarganas Margolis
Roma Thamm
Fachgebiet 34 | HIV/AIDS und andere sexuell oder durch Blut übertragbare Infektionen
Marlow Zimmermann
Fachgebiet 24 | Gesundheitsberichterstattung
Franziska Prütz
ZfKD | Zentrum für Krebsregisterdaten
Nina Buttmann-Schweiger
Julia Fiebig
Neuhauser H, Buttmann-Schweiger N, Fiebig J, Poethko-Mülle C, Prütz F, Sarganas Margolis G, Thamm R und Zimmermann M (2022):: Observatorium serologischer Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland, Berlin: Zenodo. DOI: 10.5281/zenodo.7043025.
Die seit 2019 auftretende Infektionskrankheit COVID-19, hervorgerufen durch das neuartige SARS-CoV-2-Virus, führte zu gesundheitspolitischen und gesamtgesellschaftlichen Herausforderungen. Um geeignete Maßnahmen zur Eindämmung der Pandemie ergreifen zu können und neue Erkenntnisse über die Pandemie zu gewinnen, gibt es vermehrt Forschungsbedarfe zu COVID-19. Ein Ansatzpunkt hierfür sind die gewonnenen Blutproben von infizierten sowie von nicht infizierten Personen, die in Laboren auf Antikörper gegen das SARS-CoV-2-Virus getestet und analysiert werden. Sie geben Aufschluss über den Anteil der Bevölkerung, der bereits eine Infektion mit SARS-CoV-2 durchgemacht hat, und schließen dabei nicht erkannte Infektionen (Untererfassung) ein.
Das Projekt „Observatorium serologischer Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland" (SERO-OBS Corona) gibt eine Übersicht zu Antikörper-Studien (sogenannte seroepidemiologische Studien) in Deutschland. Die seroepidemiologischen Studien basieren auf Blutproben von Bürgerinnen und Bürgern, die zu unterschiedlichen Zeitpunkten der Pandemie auf Antikörper gegen das SARS-CoV-2-Virus getestet wurden. Dabei sollen z. B. folgende Fragen beantwortet werden: Wie ist die Häufigkeit von SARS-CoV-2-Infektionen in verschiedenen Bevölkerungsgruppen? Wie hoch ist der Untererfassungsfaktor, der zeigt, wie viel Mal mehr Infektionen im Vergleich zu den bislang bekannten (gemeldeten) Fällen aufgetreten sind? In dem vorliegenden Projekt werden in Deutschland durchgeführte seroepidemiologische Studien zu SARS-CoV-2 seit dem Frühjahr 2020 über systematische Recherchen in Studienregistern, Literaturdatenbanken einschließlich Vorveröffentlichungen sowie Medienberichten fortlaufend indentifiziert und Studieninformationen sowie Ergebnisübersichten verfügbar gemacht.
Die Ergebnisse des Projektes SERO-OBS-Corona werden auf der Webseite www.rki.de/covid-19-ak-studien, auf Deutsch, sowie der Webseite www.rki.de/covid-19-serostudies-germany, auf Englisch, bereitgestellt und regelmäßig aktualisiert.
Im Projekt „Observatorium serologischer Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland" (SERO-OBS Corona) wirken verschiedene Fachgebiete der Abteilung 2 | Epidemiologie und Gesundheitsmonitoring und Abteilung 3 | Infektionsepidemiologie des Robert Koch-Instituts mit. Wir bedanken uns bei dem Team von SeroTracker (serotracker.com) der Universität Calgary für hilfreiche Diskussionen und Beiträge zur Operationalisierung der Studiendatenbank sowie für die initiale Programmierung der interaktiven Graphiken.
Inhaltliche Fragen bezüglich der Datenextraktion können direkt an das Team des Projektes SERO-OBS-Corona unter COVID19_AK@rki.de gestellt werden. Die Veröffentlichung der Daten sowie das Qualitätsmanagement der (Meta-)Daten erfolgen durch das Fachgebiet MF 4 | Forschungsdaten- und Infromationsmanagement. Fragen zum Datenmanagement und zur Publikationsinfrastruktur können an das Open Data Team des Fachgebiets MF4 unter OpenData@rki.de gerichtet werden.
Das Projekt „Observatorium serologischer Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland (SERO-OBS Corona)“ wird durch das Bundesministerium für Gesundheit gefördert.
Seroepidemiologische Studien sind seit Beginn der COVID-19-Pandemie von hohem Interesse. Sie geben Aufschluss über den Anteil der Bevölkerung, der bereits eine Infektion mit SARS-CoV-2 durchgemacht hat, und schließen dabei nicht erkannte Infektionen (Untererfassung) ein.
Diese Studien werden seit dem Frühjahr 2020 über systematische Recherchen in Studienregistern, Literaturdatenbanken einschließlich Vorveröffentlichungen sowie Medienberichten fortlaufend identifiziert. Die übergeordnete Suchstrategie des RKI zum neuartigen Coronavirus ist in der Fachzeitschrift GMS der Arbeitsgemeinschaft für Medizinisches Bibliothekswesen veröffentlicht (Erling J, Heldt K, Sturm J, 2021).
Erling J, Heldt K, Sturm J. Lessons learned from the pandemic – ein Praxisbericht aus der Bibliothek des Robert Koch-Instituts. GMS Med Bibl Inf. 2021;21(1-2):Doc05. DOI: 10.3205/mbi000494
Es erfolgt eine kritische Bewertung der Studien, die Extraktion aggregierter Daten aus bereits vorliegenden Studien aus Deutschland sowie deren Aufbereitung für Analysen, für eine interaktive Karte, für ein Dashboard und für die Aktualisierung eines Factsheets zu den Ergebnissen seroepidemiologischer SARS-CoV-2-Studien in der Allgemeinbevölkerung in Deutschland. Weiterhin werden Recherchen und Analysen zur Untererfassung und Infection Fatality Rate durchgeführt. Die Ergebnisse des Projektes SERO-OBS-Corona werden auf der Webseite www.rki.de/covid-19-ak-studien auf Deutsch sowie der Webseite www.rki.de/covid-19-serostudies-germany auf Englisch bereitgestellt und regelmäßig aktualisiert.
Das Projekt „Observatorium serologischer Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland" (SERO-OBS Corona) gibt somit einen Überblick über in Deutschland durchgeführte seroepidemiologische Studien zu SARS-CoV-2. Folgende Veröffentlichungen sind im Projekt entstanden:
Neuhauser H, et. al : Seroepidemiologische Studien zu SARS-CoV-2 in Stichproben der Allgemeinbevölkerung und bei Blutspenderinnen und Blutspendern in Deutschland – Ergebnisse bis August 2021 Epid Bull 2021;37:3 -12 | DOI: 10.25646/8999
Thamm, R., et al. SARS-CoV-2-Seroprävalenz bei Kindern und Jugendlichen in Deutschland – ein Überblick. Bundesgesundheitsblatt 64, 1483–1491 (2021). DOI: 10.1007/s00103-021-03448-0
Poethko-Müller C, et al.: Studien zur Seroprävalenz von SARS-CoV-2 in Deutschland und international. JoHM 2020;5(S(4)):2-16. DOI: 10.25646/7023
Neuhauser H, et al.: Ergebnisse seroepidemiologischer Studien zu SARS-CoV-2 in Stichproben der Allgemeinbevölkerung und bei Blutspenderinnen und Blutspendern in Deutschland (Stand 3.12.2020). Epid Bull 2020;50:3-6. DOI: 10.25646/7728
Robert Koch-Institut (2021) SARS-CoV-2-Seroprävalenz in der Allgemeinbevölkerung in Deutschland. Stand: 23. November 2021. DOI: 10.25646/9288
Robert Koch-Institut (2022) SARS-CoV-2-Seroprävalenz in der Allgemeinbevölkerung in Deutschland – Aktualisierung Juni 2022. https://edoc.rki.de/handle/176904/9849.2
Robert Koch-Institut (2022) SARS-CoV-2-Seroprävalenz in der Allgemeinbevölkerung in Deutschland – Aktualisierung September 2022. DOI: 10.25646/9693.3
Informationen und Ergebnisse epidemiologischer Studien zur Seroprävalenz von SARS-CoV-2 in Zufallsstichproben der Allgemeinbevölkerung, bei Blutspenderinnen und Blutspendern in Deutschland und in besonderen Bevölkerungsgruppen wurden systematisch recherchiert und Eckdaten bereitgestellt.
Recherche und Suchstrategie: Seroepidemiologische Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland, die als peer-reviewte Publikation (mit wissenschaftlicher Begutachtung) in Literaturdatenbanken auffindbar sind (PubMed und Embase). Ebenso gesucht wird nach Manuskripten, die vor dem Peer-Review auf sogenannten Preprint-Servern veröffentlicht wurden (medRxiv, bioRxiv, arXiv, ChemRxiv, preprints.org, ResearchSquare, Social Science Research Network (SSRN)).
Die definierten Suchbegriffe im Titel der Publikationen aus Funden einer ersten Suche nach SARS-CoV-2 und verwandten Begriffen sind „sero OR antibod OR immune OR immunity OR immunology OR fatality rate OR population-based OR cohort study OR dried blood OR test strategy ”.
Auch Berichte und Meldungen der WHO, des European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) und des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) sowie Studienregister (Deutsches Register Klinischer Studien, ClinicalTrials.gov) wurden durchsucht und die Medienberichterstattung verfolgt.
Der Datensatz enthält Ergebnisse und Informationen aus seroepidemiologischen Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland. Zusätzlich werden grundlegende Metadaten sowie die Datensatzdokumentation bereitgestellt. Im Datensatz enthalten sind:
- Tabellen mit Studieninformationen und Ergebniszusammenfassungen
- Datensatzdokumentation in deutscher Sprache
- Lizenz-Datei mit der Nutzungslizenz des Datensatzes in Deutsch und Englisch
- Metadaten-Dateien mit Kontextinformationen
Die Daten des Projekts "Observatorium serologischer Studien zu SARS-CoV-2 in Deutschland" (SERO-OBS Corona) sind im Hauptverzeichnis, in deutscher und englsicher Spache, in den Datenformaten .csv, .json und .xlsx abrufbar:
SERO-OBS_SARS-CoV-2_in_Deutschland.csv
SERO-OBS_SARS-CoV-2_in_Deutschland.json
SERO-OBS_SARS-CoV-2_in_Deutschland.xlsx
SERO-OBS_SARS-CoV-2_in_Germany.csv
SERO-OBS_SARS-CoV-2_in_Germany.json
SERO-OBS_SARS-CoV-2_in_Germany.xlsx
Die bereitgestellten Daten differenzieren nach übergeordneten Merkmalen:
- Informationen zur Studie und zum Studiendesign
- Ergebnis-Informationen
- zur Seroprävalenzangabe (Wert, KI, Adjustierung etc.),
- zum Untererfassungsfaktor
Eine Studie hat immer einen eindeutigen Namen, kann jedoch sowohl mehrere Publikationen umfassen, mehrere Studienorte haben etc. Bei Wechsel vom preprint zum Vollprint werden Information aktualisiert, wenn die spezifischen Ergebnisse (bspw. nach Alter, Gegend, Zeitraum) noch einmal neu berechnet wurden und voneinander abweichen. Die Einträge werden von einer Person angelegt, von einer zweiten Person qualitätsgesichert und bei Uneinigkeit in der Arbeitsgruppe besprochen.
Der Datensatz enthält folgende Variablen und mit ihren entsprechenden Ausprägungen:
| Variable | Typ | Ausprägung | Erläuterung |
|---|---|---|---|
| title | Text | $Name |
Name aus Eigenangaben, DRKS, Studientitel |
| type | Text | Querschnitt, Längsschnitt/Prospektive Kohortenstudie, Quer- und selektiver Längsschnitt, Wiederholte Querschnitte |
Querschnitt bei einmaliger Beprobung; Längsschnitt bei wiederholter Beprobung der gleichen Teilnehmenden über die Zeit; Quer- und selektiver Längsschnitt bei Auswahl der Teilnehmenden zu Studienbeginn und selektiver Auswahl der weiteren zu beprobenden Teilnehmenden aus dem Pool bereits Eingeschlossener; Wiederholte Querschnitte bei wiederholter Beprobung an einem Ort/über ein Rekrutierungsverfahren zu mehreren Zeitpunkten. |
| start_date | Datum | JJJJ-MM-TT |
Eindeutigstes Datum des Beginns der Probenentnahme, falls nur Monatsangabe verfügbar: wurde der 01. des Monats angegeben; bei Angabe einer Zeitspanne wurde der 15. des Monats gewählt |
| end_date | Datum | JJJJ-MM-TT |
Eindeutigstes Datum des Endes der Probenentnahme, falls nur Monatsangabe verfügbar: wurde der 01. des Monats angegeben; bei Angabe einer Zeitspanne wurde der 15. des Monats gewählt |
| organisation_$ | Text | $Name |
Name der Probennehmenden Organisation |
| organisation_raw | Text | $Name,$Name,.... |
Namen der Probennehmenden Organisationen |
| location_$ | Text | $Name |
Kleinräumigste Angabe zur Beprobungsregion (z.B. Stadt, Kreis, Gemeinde) des Studienortes (Einzelwerte) |
| location_raw | Text | $Name,$Name,... |
Kleinräumigste Angabe zur Beprobungsregion (z.B. Stadt, Kreis, Gemeinde) des Studienortes |
| region | Text | Bundesweit, Baden-Württemberg, Bayern, ..., Thüringen, Multilokal |
Name des Bundeslandes sowie ein Wert für das gesamte Bundesgebiet und Bundesland übergreifende Erhebungen (Mulitlokal) |
| registry_url | Text | https://www.NAME.de |
Link zum Studienregistereintrag (bspw. DRKS) |
| information_url | Text | https://www.NAME.de |
Link zur Studienseite (bspw. SARS-CoV-2: Antikörper-Studien des RKI) |
| resource_url_$ | Text | https://www.Name1.de |
Angabe zum Link zu Publikation/Bericht, die im Rahmen der Studie veröffentlicht wurden. (Einzelwerte) |
| scope_regionality | Text | Bundesweit, Lokal/Regional |
Der beschriebene räumliche Abdeckungsgrad des Schätzers (bspw. welche Region soll der Schätzer repräsentieren.,Lokal/Regional: innerhalb eines Bundeslands, Bundesweit: mehrere Bundesländer |
| scope_population | Text | Allgemeinbevölkerung, Besondere Bevölkerungsgruppen, Allgemeinbevölkerung und besondere Bevölkerungsgruppen |
Die Stichprobe repräsentiert die Allgemeinbevölkerung oder gibt einen Eindruck der Seroprävalenz in Bevölkerungsgruppen, die eine Auswahl der Allgemeinbevölkerung darstellen. Bspw. Zielpopulation einer Studie von Schülerinnen und Schülern im schulpflichtigen Alter eines Bundeslandes sollen die Seroprävalenz der Allgemeinbevölkerung dieses Alters wiedergeben; Lehrpersonal hingegen stellt als Zielpopulation eine besondere Bevölkerungsgruppe dar. |
| scope_age | Text | Erwachsene, Kinder/Jugendliche, Mehrere |
Die Auswahl erfolgt exklusiv. Kinder und Jugendlich sind <=18 Jahre |
| subject_frame | Text | Auswahl des Rahmens, in dem die Stichprobe gezogen wurde, für die das Ergebnis zur Seroprävalenz abgebildet wird. Die Auswahl gibt die Gruppe wieder, die in der Studie am spezifischsten beschrieben wurde (bspw. Bewohnende von Altenheimen anstatt Wohnbevölkerung) | |
| subject_information | Text | Verknüpfung von Informationen aus dem Stichprobenrahmen und dem Studienort und ggfs. weiteren relevanten Charakteristika der Stichprobe im Sinne einer Kurzbeschreibung. | |
| subject_vaccination | Text | Seroprävalenz in allen Teilnehmenden, Anteil der Seropositiven in Ungeimpften / in Teilnehmenden vor 2021, Anteil der Seropositiven in Geimpften, Anteil der Seropositiven in Ungeimpften |
Spezifikation des Impfstatus der Teilnehmenden zu den in den Grafiken dargestellten Ergebnissen. |
| sample_design | Text | Nicht-zufällige Ziehung, Blutspende, Vollerhebung der Grundgesamtheit, Kohortenstichprobe, Nicht-Einwohnermeldeamts-Zufallsstichprobe, Einwohnermeldeamts-Zufallsstichprobe, Mehrstufige, teilweise zufällige Ziehung |
Nicht-zufällige Ziehung/convenience sample: Nicht zufällige Teilnehmendenrekrutierung aus einfach verfügbaren Gruppen. Blutspende: Anonymisierte Restproben aus Blutspenden werden für die Studie verwendet. Vollerhebung: Jede Person innerhalb einer Population wird in die Studie eingeschlossen. Kohortenstichprobe: Stichprobe aus einer bestehenden Kohortenstudie in der Allgemeinbevölkerung. Nicht-Einwohnermeldeamts-Zufallsstichprobe: Nicht auf Basis einer Einwohnermeldeamtsstichprobe zufällig ausgewählte Teilnehmende. Einwohnermeldeamts-Zufallsstichprobe: Auf Basis einer Einwohnermeldeamtsstichprobe zufällig ausgewählte Teilnehmende. Mehrstufige, teilweise zufällige Ziehung: Mehrstufige Stichprobenziehung, nicht in allen Stufen zufällig. |
| sample_analysis_unit | Text | Teilnehmende, Haushalte mit Teilnehmenden;,Samples von Teilnehmenden, Arztpraxen mit Teilnehmenden |
Einheit der Stichprobenziehung |
| age_max | Ganze Zahl | Höchstes Alter von in die Studie eingeschlossenen Teilnehmenden | |
| age_min | Ganze Zahl | Geringstes Alter von in die Studie eingeschlossenen Teilnehmenden | |
| sample_size_obtained | Ganze Zahl | Anzahl der in die Studie eingeschlossenen Teilnehmenden | |
| sample_size_rounded | Ganze Zahl | Gerundet Wert von sample_size_obtained | |
| analysis_data_source | Text | Vollblut, Kapillarblut,Blutplasma, Kein Blut, Sputum |
Methode der Blutabnahme für Antikörperbestimmung |
| analysis_target | Text | anti -S1 domain, anti -RBD domain, anti Nucleocapsid, multiple |
Zielstruktur des Virus, gegen die sich die in der Studie bestimmten Antikörper richten. |
| analysis_isotype | Text | Gesamt Ig-Antikörper, IgG, Mehrere |
Angaben zur Antikörperklasse, auf die sich die berichtete Seroprävalenz bezieht. |
| analysis_test | Text | ELISA, Elektrochemolumineszenz (ECL)-Immunassay, LIPS, andere |
Angaben zum laboranalytischen Testverfahren, mit dem die Antikörperbestimmung durchgeführt wurde . |
| analysis_test_manufacturer_$ | Text | $Name |
Hersteller des Testassays. (Einzelwerte) |
| analysis_test_manufacturer_raw | Text | $Name, Name, Name, ... |
Hersteller des Testassays. |
| results_publication_url | Text | https://www.NAME.de |
Referenz auf Quelle, in der die Information zum jeweiligen Ergebnis (bspw. Seroprävalenz, Dunkelziffer) vorgehalten wird. |
| results_publication_date | Datum | JJJJ-MM-DD |
Veröffentlichungsdatum der Referenz auf Quelle, in der die Information zum jeweiligen Ergebnis (bspw. Seroprävalenz, Dunkelziffer) vorgehalten wird. |
| results_publication_type | Text | Typ der Quelle, in der die Information zum jeweiligen Ergebnis (bspw. Seroprävalenz, Dunkelziffer) vorgehalten wird (bspw. Pre-Print, Vollveröffentlichung als Peer-reviewte Publikation). | |
| results_seroprevalence_ adjustment | Text | Nicht adjustiert, Bevölkerungsgewichtet, Adjustiert für Test-Güte, Adjustiert für Test-Güte und bevölkerungsgewichtet |
Adjustierung der Seroprävalenz für Faktoren wie Test-Güte, Bevölkerung: Bei mehreren Varianten wurde die höchste Adjustierung angegeben. |
| results_seroprevalence_ sensitivity | decimal | Testgüteeigenschaften des Antikörpertests, die für die Analysen herangezogen wurden. | |
| results_seroprevalence_ specificity | decimal | Testgüteeigenschaften des Antikörpertests, die für die Analysen herangezogen wurden. | |
| results_seroprevalence_ positive | decimal | Seroprävalenzangaben mit der jeweils höchsten verfügbaren bzw. aus den Studienangaben errechenbare Adjustierungsstufe. | |
| results_seroprevalence_ positive_95pct_lower | decimal | Unteres 95% Konfidenzintervall zur Seroprävalenz | |
| results_seroprevalence_ positive_95pct_upper | decimal | Oberes 95% Konfidenzintervall zur Seroprävalenz | |
| results_seroprevalence_ information | Text | Verknüpfung von Informationen zur Seroprävalenz, die bspw. den Studienort und den Probezeitraum beinhalten und ggfs. weiteren relevanten Charakteristika, die innerhalb einer Studie die ermittelten Seroprävalenzen beschreiben. | |
| results_underreporting | Text | Faktor, der zeigt, wie viel Mal mehr Infektionen im Vergleich zu den bis zum Studienmittelpunkt bekannten (gemeldeten) kumulativen Fällen aufgetreten sind. | |
| record_created | Datum | JJJJ-MM-DD |
Zeitpunkt, zu dem ein neues Ergebnis aufgenommen wurde |
| record_modified | Datum | JJJJ-MM-DD |
Zeitpunkt, zu dem ein bereits bestehendes Ergebnis angepasst wurde (z.B. peer-reviewte Vollpublikation anstelle eines Preprints) |
Die Daten der Studie sind im Datensatz als kommaseparierte .csv Datei enthalten. Der verwendete Zeichensatz der .csv Datei ist UTF-8. Trennzeichen der einzelnen Werte ist ein Komma ",".
- Zeichensatz: UTF-8
- .csv Trennzeichen: Komma ","
Zur Erhöhung der Auffindbarkeit, sind die bereitgestellten Daten mit Metadaten beschrieben. Über GitHub Actions werden Metadaten an die entsprechenden Plattformen verteilt. Für jede Plattform existiert eine spezifische Metadatendatei, diese sind im Metadaten-Ordner hinterlegt:
Versionierung und DOI-Vergabe erfolgt über Zenodo.org. Die für den Import in Zenodo bereitgestellten Metadaten sind in der zenodo.json hinterlegt. Die Dokumentation der einzelnen Metadatenvariablen ist unter https://developers.zenodo.org/#representation nachlesbar.
Offene Forschungsdaten des RKI werden auf GitHub.com, Zenodo.org und Edoc.rki.de bereitgestellt:
- https://github.com/robert-koch-institut
- https://zenodo.org/communities/robertkochinstitut
- https://edoc.rki.de
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Die im Datensatz bereitgestellten Daten sind, unter Bedingung der Namensnennung des Robert Koch-Instituts als Quelle, frei verfügbar. Das bedeutet, jede Person hat das Recht die Daten zu verarbeiten und zu verändern, Derivate des Datensatzes zu erstellen und sie für kommerzielle und nicht kommerzielle Zwecke zu nutzen. Weitere Informationen zur Lizenz finden sich in der LICENSE bzw. LIZENZ Datei des Datensatzes.