Grupo 3
Repositório criado por:
- Afonso Sá (pg54434)
- Duarte Velho (pg53841)
- Ricardo Oliveira (pg53501)
- Samuel Baptista (pg49130)
Algoritmos construidos
- Métodos de strings
- Tradução de codões e obtenção da cadeia complementar inversa para sequencias de DNA
- Extração de todas as proteínas possívies codificadas nas varias open reading frames de uma sequencia de DNA
- Alinhamento de sequências através de programação dinâmica/recursividade
- Algoritmo de Needleman Wunsch
- Blast
- Motifs
- Análise filogenética
Este repositório foi criado no ambito da UC Algoritmos para Análise de Sequências Biológicas (2023/24), do Mestrado em Bioinformática da Escola de Engenharia da Universidade do Minho, e tem como objetivo reunir os scripts e notebooks construídos ao longo da realização do trabalho.
Neste repositório são apresentadas as implementações dos algoritmos leccionados no âmbito da UC. No código presente neste portfólio, encontra-se a documentação do código, Type hinting, Unit tests e todas as fontes onde se foi buscar código.
Este repositório destaca-se pela originalidade e a autoria do código escrito.