add TCG, full numerical virial, new TESTVIR program

comecattin · Aug 26, 2018 · 4dae10b · 4dae10b
1 parent d89d354
commit 4dae10b
Show file tree

Hide file tree

Showing 382 changed files with 6,439 additions and 4,734 deletions.
diff --git a/example/dhfr2.key b/example/dhfr2.key
@@ -12,4 +12,5 @@ ewald
 ewald-cutoff                    7.0
 pme-grid                   64 64 64
 pme-order                         5
+polarization                 MUTUAL
 polar-eps                   0.00001
diff --git a/example/watersmall.key b/example/watersmall.key
@@ -11,5 +11,6 @@ list-buffer                     1.0
 vdw-cutoff                      8.0
 ewald
 ewald-cutoff                    7.0
+
 polarization                 MUTUAL
 polar-eps                  0.000001
diff --git a/linux/gfortran/compile.make b/linux/gfortran/compile.make
@@ -119,7 +119,9 @@ gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp pitors.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp pme.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp polar.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp polgrp.f
+gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp polopt.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp polpot.f
+gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp poltcg.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp potent.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp potfit.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp precis.f
@@ -451,7 +453,7 @@ gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp overlap.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp path.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp pdbxyz.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp picalc.f
-gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp pmestuff.f
+gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp pmestuf.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp pmpb.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp polarize.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp poledit.f
@@ -504,7 +506,7 @@ gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp server.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp shakeup.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp sigmoid.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp simplex.f
-gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp sktstuff.f
+gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp sktstuf.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp sniffer.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp sort.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp spacefill.f
@@ -515,12 +517,14 @@ gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp superpose.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp surface.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp surfatom.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp switch.f
+gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp tcgstuf.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp temper.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp testgrad.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp testhess.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp testpair.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp testpol.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp testrot.f
+gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp testvir.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp timer.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp timerot.f
 gfortran -c -Ofast -mavx -fopenmp tncg.f

diff --git a/linux/gfortran/debug.make b/linux/gfortran/debug.make
@@ -119,7 +119,9 @@ gfortran -c -Wall pitors.f
 gfortran -c -Wall pme.f
 gfortran -c -Wall polar.f
 gfortran -c -Wall polgrp.f
+gfortran -c -Wall polopt.f
 gfortran -c -Wall polpot.f
+gfortran -c -Wall poltcg.f
 gfortran -c -Wall potent.f
 gfortran -c -Wall potfit.f
 gfortran -c -Wall precis.f
@@ -451,7 +453,7 @@ gfortran -c -Wall overlap.f
 gfortran -c -Wall path.f
 gfortran -c -Wall pdbxyz.f
 gfortran -c -Wall picalc.f
-gfortran -c -Wall pmestuff.f
+gfortran -c -Wall pmestuf.f
 gfortran -c -Wall pmpb.f
 gfortran -c -Wall polarize.f
 gfortran -c -Wall poledit.f
@@ -504,7 +506,7 @@ gfortran -c -Wall server.f
 gfortran -c -Wall shakeup.f
 gfortran -c -Wall sigmoid.f
 gfortran -c -Wall simplex.f
-gfortran -c -Wall sktstuff.f
+gfortran -c -Wall sktstuf.f
 gfortran -c -Wall sniffer.f
 gfortran -c -Wall sort.f
 gfortran -c -Wall spacefill.f
@@ -515,6 +517,7 @@ gfortran -c -Wall superpose.f
 gfortran -c -Wall surface.f
 gfortran -c -Wall surfatom.f
 gfortran -c -Wall switch.f
+gfortran -c -Wall tcgstuf.f
 gfortran -c -Wall temper.f
 gfortran -c -Wall testgrad.f
 gfortran -c -Wall testhess.f

diff --git a/linux/gfortran/generic.make b/linux/gfortran/generic.make
@@ -119,7 +119,9 @@ gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp pitors.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp pme.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp polar.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp polgrp.f
+gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp polopt.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp polpot.f
+gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp poltcg.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp potent.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp potfit.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp precis.f
@@ -451,7 +453,7 @@ gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp overlap.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp path.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp pdbxyz.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp picalc.f
-gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp pmestuff.f
+gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp pmestuf.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp pmpb.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp polarize.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp poledit.f
@@ -504,7 +506,7 @@ gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp server.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp shakeup.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp sigmoid.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp simplex.f
-gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp sktstuff.f
+gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp sktstuf.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp sniffer.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp sort.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp spacefill.f
@@ -515,12 +517,14 @@ gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp superpose.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp surface.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp surfatom.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp switch.f
+gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp tcgstuf.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp temper.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp testgrad.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp testhess.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp testpair.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp testpol.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp testrot.f
+gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp testvir.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp timer.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp timerot.f
 gfortran -c -Ofast -msse3 -fopenmp tncg.f

diff --git a/linux/gfortran/library.make b/linux/gfortran/library.make
@@ -369,11 +369,13 @@ piorbs.o \
 pistuf.o \
 pitors.o \
 pme.o \
-pmestuff.o \
+pmestuf.o \
 pmpb.o \
 polar.o \
 polgrp.o \
+polopt.o \
 polpot.o \
+poltcg.o \
 polymer.o \
 potent.o \
 potfit.o \
@@ -432,7 +434,7 @@ shunt.o \
 sigmoid.o \
 simplex.o \
 sizes.o \
-sktstuff.o \
+sktstuf.o \
 socket.o \
 solute.o \
 sort.o \
@@ -446,6 +448,7 @@ surfatom.o \
 switch.o \
 syntrn.o \
 tarray.o \
+tcgstuf.o \
 temper.o \
 titles.o \
 tncg.o \

diff --git a/linux/gfortran/link.make b/linux/gfortran/link.make
@@ -63,6 +63,7 @@ gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o testhess.x testhess.o -L. libtinker.a
 gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o testpair.x testpair.o -L. libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testpair.x
 gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o testpol.x testpol.o -L. libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testpol.x
 gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o testrot.x testrot.o -L. libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testrot.x
+gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o testvir.x testvir.o -L. libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testvir.x
 gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o timer.x timer.o -L. libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip timer.x
 gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o timerot.x timerot.o -L. libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip timerot.x
 gfortran -Ofast -fopenmp -static-libgcc -o torsfit.x torsfit.o -L. libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip torsfit.x

diff --git a/linux/gfortran/rename.make b/linux/gfortran/rename.make
@@ -55,6 +55,7 @@ mv testhess.x  ../bin/testhess
 mv testpair.x  ../bin/testpair
 mv testpol.x   ../bin/testpol
 mv testrot.x   ../bin/testrot
+mv testvir.x   ../bin/testvir
 mv timer.x     ../bin/timer
 mv timerot.x   ../bin/timerot
 mv torsfit.x   ../bin/torsfit

diff --git a/linux/intel/compile.make b/linux/intel/compile.make
@@ -119,7 +119,9 @@ ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp pitors.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp pme.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp polar.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp polgrp.f
+ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp polopt.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp polpot.f
+ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp poltcg.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp potent.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp potfit.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp precis.f
@@ -451,7 +453,7 @@ ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp overlap.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp path.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp pdbxyz.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp picalc.f
-ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp pmestuff.f
+ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp pmestuf.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp pmpb.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp polarize.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp poledit.f
@@ -504,7 +506,7 @@ ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp server.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp shakeup.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp sigmoid.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp simplex.f
-ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp sktstuff.f
+ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp sktstuf.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp sniffer.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp sort.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp spacefill.f
@@ -515,12 +517,14 @@ ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp superpose.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp surface.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp surfatom.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp switch.f
+ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp tcgstuf.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp temper.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp testgrad.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp testhess.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp testpair.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp testpol.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp testrot.f
+ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp testvir.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp timer.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp timerot.f
 ifort -c -O3 -xHost -no-ipo -no-prec-div -openmp tncg.f

diff --git a/linux/intel/compserial.make b/linux/intel/compserial.make
@@ -119,7 +119,9 @@ ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 pitors.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 pme.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 polar.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 polgrp.f
+ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 polopt.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 polpot.f
+ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 poltcg.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 potent.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 potfit.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 precis.f
@@ -451,7 +453,7 @@ ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 overlap.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 path.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 pdbxyz.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 picalc.f
-ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 pmestuff.f
+ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 pmestuf.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 pmpb.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 polarize.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 poledit.f
@@ -504,7 +506,7 @@ ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 server.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 shakeup.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 sigmoid.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 simplex.f
-ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 sktstuff.f
+ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 sktstuf.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 sniffer.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 sort.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 spacefill.f
@@ -515,12 +517,14 @@ ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 superpose.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 surface.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 surfatom.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 switch.f
+ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 tcgstuf.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 temper.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 testgrad.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 testhess.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 testpair.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 testpol.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 testrot.f
+ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 testvir.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 timer.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 timerot.f
 ifort -c -O3 -axSSSE3 -no-ipo -no-prec-div -vec-report0 tncg.f

diff --git a/linux/intel/debug.make b/linux/intel/debug.make
@@ -119,7 +119,9 @@ ifort -c -g -warn all -check all pitors.f
 ifort -c -g -warn all -check all pme.f
 ifort -c -g -warn all -check all polar.f
 ifort -c -g -warn all -check all polgrp.f
+ifort -c -g -warn all -check all polopt.f
 ifort -c -g -warn all -check all polpot.f
+ifort -c -g -warn all -check all poltcg.f
 ifort -c -g -warn all -check all potent.f
 ifort -c -g -warn all -check all potfit.f
 ifort -c -g -warn all -check all precis.f
@@ -451,7 +453,7 @@ ifort -c -g -warn all -check all overlap.f
 ifort -c -g -warn all -check all path.f
 ifort -c -g -warn all -check all pdbxyz.f
 ifort -c -g -warn all -check all picalc.f
-ifort -c -g -warn all -check all pmestuff.f
+ifort -c -g -warn all -check all pmestuf.f
 ifort -c -g -warn all -check all pmpb.f
 ifort -c -g -warn all -check all polarize.f
 ifort -c -g -warn all -check all poledit.f
@@ -504,7 +506,7 @@ ifort -c -g -warn all -check all server.f
 ifort -c -g -warn all -check all shakeup.f
 ifort -c -g -warn all -check all sigmoid.f
 ifort -c -g -warn all -check all simplex.f
-ifort -c -g -warn all -check all sktstuff.f
+ifort -c -g -warn all -check all sktstuf.f
 ifort -c -g -warn all -check all sniffer.f
 ifort -c -g -warn all -check all sort.f
 ifort -c -g -warn all -check all spacefill.f
@@ -515,12 +517,14 @@ ifort -c -g -warn all -check all superpose.f
 ifort -c -g -warn all -check all surface.f
 ifort -c -g -warn all -check all surfatom.f
 ifort -c -g -warn all -check all switch.f
+ifort -c -g -warn all -check all tcgstuf.f
 ifort -c -g -warn all -check all temper.f
 ifort -c -g -warn all -check all testgrad.f
 ifort -c -g -warn all -check all testhess.f
 ifort -c -g -warn all -check all testpair.f
 ifort -c -g -warn all -check all testpol.f
 ifort -c -g -warn all -check all testrot.f
+ifort -c -g -warn all -check all testvir.f
 ifort -c -g -warn all -check all timer.f
 ifort -c -g -warn all -check all timerot.f
 ifort -c -g -warn all -check all tncg.f

diff --git a/linux/intel/generic.make b/linux/intel/generic.make
@@ -119,7 +119,9 @@ ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp pitors.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp pme.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp polar.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp polgrp.f
+ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp polopt.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp polpot.f
+ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp poltcg.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp potent.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp potfit.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp precis.f
@@ -451,7 +453,7 @@ ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp overlap.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp path.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp pdbxyz.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp picalc.f
-ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp pmestuff.f
+ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp pmestuf.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp pmpb.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp polarize.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp poledit.f
@@ -504,7 +506,7 @@ ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp server.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp shakeup.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp sigmoid.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp simplex.f
-ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp sktstuff.f
+ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp sktstuf.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp sniffer.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp sort.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp spacefill.f
@@ -515,12 +517,14 @@ ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp superpose.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp surface.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp surfatom.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp switch.f
+ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp tcgstuf.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp temper.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp testgrad.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp testhess.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp testpair.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp testpol.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp testrot.f
+ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp testvir.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp timer.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp timerot.f
 ifort -c -O3 -msse3 -no-ipo -no-prec-div -openmp tncg.f

diff --git a/linux/intel/library.make b/linux/intel/library.make
@@ -369,11 +369,13 @@ piorbs.o \
 pistuf.o \
 pitors.o \
 pme.o \
-pmestuff.o \
+pmestuf.o \
 pmpb.o \
 polar.o \
 polgrp.o \
+polopt.o \
 polpot.o \
+poltcg.o \
 polymer.o \
 potent.o \
 potfit.o \
@@ -432,7 +434,7 @@ shunt.o \
 sigmoid.o \
 simplex.o \
 sizes.o \
-sktstuff.o \
+sktstuf.o \
 socket.o \
 solute.o \
 sort.o \
@@ -446,6 +448,7 @@ surfatom.o \
 switch.o \
 syntrn.o \
 tarray.o \
+tcgstuf.o \
 temper.o \
 titles.o \
 tncg.o \

diff --git a/linux/intel/link.make b/linux/intel/link.make
@@ -56,6 +56,7 @@ ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o testhe
 ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o testpair.x testpair.o libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testpair.x
 ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o testpol.x testpol.o libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testpol.x
 ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o testrot.x testrot.o libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testrot.x
+ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o testvir.x testvir.o libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip testvir.x
 ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o timer.x timer.o libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip timer.x
 ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o timerot.x timerot.o libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip timerot.x
 ifort -O3 -no-prec-div -recursive -openmp -static-libgcc -static-intel -o torsfit.x torsfit.o libtinker.a libfftw3_threads.a libfftw3.a ; strip torsfit.x