patient表结构理解

• PDCDM字段对应
• 设计要点
• 数据处理需求点
• 数据存在的问题
• 数据增量抽取后DDL语句
• 数据增量抽取后DDL语句

PDCDM字段对应

PDCDM扩展模型:
Patient	Patient表记录了患者的个人信息。包括出生年月、性别、民族等字段。
字段名	字段名注释	是否字典列	有数据	数据来源	数据类型	数据抓取后处理方式
Patient_ID	患者ID，患者信息表主键		Y		varchar(38)	抓取原系统的Patient_ID字段，后续该列会根据Patient_ID列处理方式进行扩展。
Sex	患者性别				varchar(30)	抓取原始系统的数据。
Birth_Date	患者生日				datetime	抓取原始系统的数据。不脱敏。
Marital_Status	婚姻状况				varchar(30)	对婚姻字段做标准化。
Race	种族/民族				varchar(30)	对民族字段做标准化。
RAW_Race	种族/民族原始值	Y			varchar(30)	抓取原系统的数据。
RAW_Sex	性别原始值	Y			varchar(30)	抓取原系统的数据。
RAW_Birth_Date	患者生日原始值,只处理原始数据库日期为字符类型的数据				varchar(30)
RAW_Marital_Status	婚姻状况原始值	Y			varchar(30)	抓取原系统数据。
Patient_Name	患者姓名				varchar(50)	抓取原系统的数据。
Patient_Phone	手机或电话				varchar(30)	抓取原系统的数据。
Patient_ID_Card	患者身份证				varchar(30)	对原数据不合法的，进行置空。
Provider_ID	医疗机构编码		Y		varchar(30)	医院编号。
Update_Datetime	记录抓取到PDCDM的时间戳，用于后续增量处理数据		Y		datetime	数据抓取时间戳，用于标记该记录抓取时间。

附：（济南二院例）

jn_n2_his_comm.marital_status_dict		婚姻字典表
patient	RAW_Marital_Status	1	WH	未婚
patient	RAW_Marital_Status	2	YH	已婚
patient	RAW_Marital_Status	3	SO	丧偶
patient	RAW_Marital_Status	4	LH	离婚
patient	RAW_Marital_Status	9	QT	其他

设计要点:

						
描述该表添加的的一些辅助字段，例如辅助的时间日期字段、诊断序号等。需要写明添加原因。

数据处理需求点：

填写处理比较复杂的字段的处理方法。处理简单的字段，直接写在上述的表格中即可。
分为全局（仅写在patient表的文档中）和该表。
全局：

本表：
例如二院：				
1.对Patient_ID列进行扩展处理。
2.对性别、婚姻和民族做字典化处理。民族字段中很多用了单字的简写方式。保留相关解析时的字典信息。
3.身份证号存在不合法需置空。

						

数据存在的问题：

						
描述具体表存在的一些问题。如数据月份缺失，数据质量较差等。
例如二院：
1.2013.9.1日后入院的门诊患者中，至少有21835例患者身份证信息存在错误（位数不是15或者18位），  
2017.1.1后有13141例，例如patient_id为0000061936,  00032109,0000069630等，  
其中主要有身份证尾号少了一位和、填写了一位数字或填了无意义的信息，填了患者生日等几种错误。  
2013.9.1后入院的住院患者有1332例患者身份证信息存在错误（位数不是15或者18位），  
2017.1.1后有163例，例如patient_id为0000006382,0000002280,等，  
中主要有身份证尾号少了一位、填写了一位数字或填无等几种错误。  
【参考jn_n2_his_medrec.pat_master_index表，jn_n2_his_outpadm.clinic_master表，jn_n2_his_medrec.pat_visit表】。	

数据增量抽取后DDL语句：(可根据实际情况进行修改)

CREATE TABLE IF NOT EXISTS `patient` (
  `Patient_ID` varchar(38) NOT NULL COMMENT 'Patient 表中的患者唯一标识，患者个人ID',
  `Sex` varchar(8) DEFAULT NULL COMMENT '患者性别',
  `Birth_Date` datetime DEFAULT NULL COMMENT '患者生日,不包括日期,脱敏后只包括年份和月份',
  `Marital_Status` varchar(8) DEFAULT NULL COMMENT '婚姻状况,已婚,未婚',
  `Race` varchar(8) DEFAULT NULL COMMENT '种族/民族',
  `Raw_Race` varchar(20) DEFAULT NULL COMMENT '种族/民族',
  `Raw_Sex` varchar(20) DEFAULT NULL COMMENT '性别原始值',
  `RAW_Birth_Date` varchar(30) DEFAULT NULL COMMENT '患者生日原始值，只处理原始数据库日期为字符类型的数据',
  `RAW_Marital_Status` varchar(30) DEFAULT NULL COMMENT '患者婚姻状况原始值',
  `Patient_Name` varchar(38) DEFAULT NULL COMMENT '患者姓名原始值',
  `Patient_Phone` varchar(38) DEFAULT NULL COMMENT '患者手机或电话原始值',
  `Patient_ID_Card` varchar(38) DEFAULT NULL COMMENT '患者身份证号原始值',
  `Provider_ID` varchar(30) DEFAULT NULL COMMENT '医疗机构编码',
  `Update_Datetime` datetime DEFAULT NULL COMMENT '记录更新时间',
  PRIMARY KEY (`Patient_ID`)
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COMMENT='患者信息表';				

最终CDM的DDL语句(PDCDM扩展模型)：

CREATE TABLE IF NOT EXISTS `patient` (
  `Patient_ID` varchar(50) NOT NULL COMMENT 'Patient 表中的患者唯一标识，患者个人ID',
  `Sex` varchar(8) DEFAULT NULL COMMENT '患者性别',
  `Birth_Date` datetime DEFAULT NULL COMMENT '患者生日,不包括日期,脱敏后只包括年份和月份',
  `Marital_Status` varchar(8) DEFAULT NULL COMMENT '婚姻状况,已婚,未婚',
  `Race` varchar(8) DEFAULT NULL COMMENT '种族/民族',
  `Raw_Race` varchar(20) DEFAULT NULL COMMENT '种族/民族',
  `Raw_Sex` varchar(20) DEFAULT NULL COMMENT '性别原始值',
  `RAW_Marital_Status` varchar(30) DEFAULT NULL COMMENT '患者婚姻状况原始值',
  `Birth_Date_MD5` varchar(38) DEFAULT NULL COMMENT '患者生日MD5值',
  `Name_MD5` varchar(38) DEFAULT NULL COMMENT '患者姓名MD5值',
  `Phone_MD5` varchar(38) DEFAULT NULL COMMENT '患者手机或电话MD5值',
  `ID_Card_MD5` varchar(38) DEFAULT NULL COMMENT '患者身份证号MD5值',
  `Provider_ID` varchar(30) DEFAULT NULL COMMENT '医疗机构编码',
  `Update_Datetime` datetime DEFAULT NULL COMMENT '记录更新时间',
  PRIMARY KEY (`Patient_ID`)
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COMMENT='患者信息表';"				

统计信息

--patient 统计本表相关的数据，一般按月来统计。需要保留查询语句。（所有表都有该要求） 每个月患者独立患者数,分住院和非住院（门诊、急诊等），以及就诊患者数。count(distinct patient_id)。

--visit 每个月住院和非住院（门诊、急诊等）就诊数。

--diagnosis 每个月住院和非住院（门诊、急诊等）诊断患者数(count(distinct patient_id))、诊断就诊数（count(distinct visit_id)）。 住院和非住院（门诊、急诊等）的诊断记录数(count(*))。

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jn_n2_his_comm.marital_status_dict		婚姻字典表
patient	RAW_Marital_Status	1	WH	未婚
patient	RAW_Marital_Status	2	YH	已婚
patient	RAW_Marital_Status	3	SO	丧偶
patient	RAW_Marital_Status	4	LH	离婚
patient	RAW_Marital_Status	9	QT	其他