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Description
(此 ISSUE 为 PaddlePaddle Hackathon 活动的任务 ISSUE,更多详见PaddlePaddle Hackathon)
螺旋桨(PaddleHelix)是一个生物计算工具集,是用机器学习的方法,特别是深度神经网络,致力于促进以下领域的发展:新药发现、疫苗设计、精准医疗 等。
【任务说明】
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任务题目:药物虚拟筛选系统设计
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技术标签:深度学习、C++、python、生物计算
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任务难度:简单
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详细说明:虚拟筛选(Virtual Screening)是药物研发中的重要一环,其目的是从大量化合物中筛选出具备高生物活性的化合物,进而进行生物活性实验的验证。过往,一般是直接通过高通量筛选技术进行药物筛选,成本高,耗时长。近几年,随着机器学习和深度学习技术的发展,融合 AI 算法的药物虚拟筛选技术,能够大大提升药物筛选的效率,并越来越多的受到青睐。在这个任务中,需要你借助 PaddleHelix 提供的化合物活性预测(或称药物靶点相互作用,DTI)模型,设计药物虚拟筛选的系统及功能,以更好的辅助药物研发人员进行药物筛选。
【提交内容】
- 项目 PR 到 PaddleHelix
- 相关技术文档
- 项目单测文件
【技术要求】
- 了解药物的虚拟筛选流程
- 了解 Paddle 相关的技术背景
- 产出一个药物虚拟筛选系统
- 若系统包含可视化模块可额外加分