MI-Lab Übung E04-FDM

Registrierung von Forschungsvorhaben und Ablage in einem Forschungsdatenmanagementsystem

Lokale Installation

Navigieren Sie in den Ordner Setup und führen dort im Terminal docker-compose up -d aus. Das zieht alle Docker images von einem Server. Der Download dauert ca. 5 min. Nachdem alle Images gestartet sind können Sie im Browser http://localhost:3000 aufrufen um auf den lokalen Local Data Hub zuzugreifen und sich anzumelden.

Ordnerstruktur

• Aufgaben/ Beinhaltet Übungsblatt, Präsentationsfolien und Lösungen
• Material/
  • Datensatz/ Der MIMIC-Datensatz für diese Übung in CSV-Format
  • Studiendokumente/ Die synthetischen Studiendokumente zum Hochladen in das Forschungsdatenmanagementsystem.
• Setup/ Docker Compose Setup für LDH

Studiendokumente

Eine Übersicht der synthetischen zu hochladenden Studiendokumente für den MIMIC IV Demo Datensatz:

Dokument	Beschreibung
Forschungsdatenmanagementplan (FDMP)	Wie Forschungsdaten erstellt, verarbeitet, gespeichert und geteilt werden
Studienprotokoll	Enthält Ziel, Design und Methodik der Studie
Datenqualitätsregeln	Standards und Kriterien für die Datenqualität
Data Dictionary	Struktur und Variablen des Datensatzes. Erleichtert Interpretation der Daten