Выполнение ручного запуска скрпитов разработчика в контейнере (комманда "docker-compose exec php-fpm bash") возможно с помощью файла "cli.php"(в котором будетлежать его скрипт), файл будет лежать рядом с папкой "public". Подключение к базе данных проверил зайдя в контейнер "db" с помощью команды "docker-compose exec db mysql -uroot -pROOT".