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Este material está diseñado para el contexto de trabajo aúlico de la cátedra de Bioinformática de las carreras Tecnicatura en Programación Informática y Licenciatura Informática de la Universidad Nacional de Quilmes.
Podés encontrar material interactivo para estudiar alineamientos de secuencias en el siguiente enlace: https://flbulgarelli.github.io/umi/#una-palabra-no-dice-nada-y-al-mismo-tiempo-lo-dice-todo
Esta actividad requiere la instalación de Anaconda y las librerías Pandas y seaborn (ver guía de instalación de Python)
Para el trabajo práctico de alineamientos estructurales utilizaremos el software Pymol (que puede ser instalado siguiendo el tutorial https://pymolwiki.org/index.php/Linux_Install )
Los trabajos prácticos relativos al modelado molecular requieren la instalación de Modeller (ver tutorial de instalación ). Recomiendo la instalación utiizando conda en caso de tener instalado Anaconda como distribución de Python.
| Nombre | Url | Práctica | Pros | Contras |
|---|---|---|---|---|
| Learn Genomics | https://learngenomics.dev/ | 10% | De lectura rápida | En inglés, sin traducción. Práctica muy escasa, no profundiza los contenidos. Solo aborda contenidos de genómica y biología básica |
| Carpentries | https://software-carpentry.org/lessons/ | 50 % | De lectura rápida. Bien explicado y con traducciones a muchos idiomas | Solo contenido de programación |
| Introduccioón a la Bioinformática | https://github.com/AJVelezRueda/Introduccion_a_la_Bioinformatica | 50% | En español, con prácticas múltimples en diferentes temas | Contenido introductorio con foco en Bioinformática y no tanto en programación |
| Herramientas Bioinformáticas para el análisis de estructura, desorden e interacciones de proteínas | https://bioinformatica-iib.github.io/estructural/contenidos/ | 50% | En español. Con teorías y prácticas detalladas | Requiere instalaciones. Solo de bioinformática estructural |
| Nombre | Url | Práctica | Pros | Contras |
|---|---|---|---|---|
| Bioinformática con ñ | https://tess.elixir-europe.org/materials/bioinformatica-con-n | 0% | Abarca múltiples temáticas en el área. En español. | Libre y Gratuito |
| Python para Científicos | https://pyciencia.taniquetil.com.ar/ | 0% | En español,con foco en temáticas importantes para el ámbito científico | Libre y Gratuito. |