作者:吴晓均
“工欲善其事,必先利其器”,知识图谱作为一种特殊的图结构,自然需要专门的图数据库进行存储。
知识图谱由于其数据包含实体、属性、关系等,常见的关系型数据库诸如MySQL之类不能很好的体现数据的这些特点,因此知识图谱数据的存储一般是采用图数据库(Graph Databases)。而Neo4j是其中最为常见的图数据库。
首先在 Neo4J官网 下载 Neo4J。
- Neo4J分为社区版和企业版:
- 企业版:收费,在横向扩展、权限控制、运行性能、HA等方面都比社区版好,适合正式的生产环境;
- 社区版:免费,普通的学习和开发采用免费社区版就好。
- 在Mac或者Linux中,安装好jdk后,直接解压下载好的Neo4J包,运行命令
bin/neo4j start
- windows系统下载好neo4j和jdk 1.8.0后,输入以下命令启动后neo4j
neo4j.bat console
图 12 Neo4j 运行结果
Neo4J 提供了一个用户友好的 Web 界面,可以进行各项配置、写入、查询等操作,并且提供了可视化功能。类似ElasticSearch一样,我个人非常喜欢这种开箱即用的设计。
打开浏览器,输入http://127.0.0.1:7474/browser/,如下图 13 所示,界面最上方就是交互的输入框。
图 13 Neo4J Web界面
- Cypher:
- 介绍:是Neo4J的声明式图形查询语言,允许用户不必编写图形结构的遍历代码,就可以对图形数据进行高效的查询。
- 设计目的:类似SQL,适合于开发者以及在数据库上做点对点模式(ad-hoc)查询的专业操作人员。
- 其具备的能力包括:
- 创建、更新、删除节点和关系
- 通过模式匹配来查询和修改节点和关系 - 管理索引和约束等
这个案例的节点主要包括人物和城市两类,人物和人物之间有朋友、夫妻等关系,人物和城市之间有出生地的关系。
- Person-Friends-PERSON
- Person-Married-PERSON
- Person-Born_in-Location
- 删除数据库中以往的图,确保一个空白的环境进行操作【注:慎用,如果库内有重要信息的话】:
图 14 Neo4J 删库操作
MATCH (n) DETACH DELETE n
这里,MATCH是匹配操作,而小括号()代表一个节点node(可理解为括号类似一个圆形),括号里面的n为标识符。
- 创建一个人物节点:
CREATE (n:Person {name:'John'}) RETURN n
注:
CREATE是创建操作,Person是标签,代表节点的类型。
花括号{}代表节点的属性,属性类似Python的字典。
这条语句的含义就是创建一个标签为Person的节点,该节点具有一个name属性,属性值是John。
- 创建更多的人物节点,并分别命名:
CREATE (n:Person {name:'Sally'}) RETURN n
CREATE (n:Person {name:'Steve'}) RETURN n
CREATE (n:Person {name:'Mike'}) RETURN n
CREATE (n:Person {name:'Liz'}) RETURN n
CREATE (n:Person {name:'Shawn'}) RETURN n
如图 15 所示,6个人物节点创建成功
图 15 创建 人物节点
- 创建地区节点
CREATE (n:Location {city:'Miami', state:'FL'})
CREATE (n:Location {city:'Boston', state:'MA'})
CREATE (n:Location {city:'Lynn', state:'MA'})
CREATE (n:Location {city:'Portland', state:'ME'})
CREATE (n:Location {city:'San Francisco', state:'CA'})
可以看到,节点类型为Location,属性包括city和state。
如图 16 所示,共有6个人物节点、5个地区节点,Neo4J贴心地使用不用的颜色来表示不同类型的节点。
图 16 创建地区节点
- 朋友关系
MATCH (a:Person {name:'Liz'}),
(b:Person {name:'Mike'})
MERGE (a)-[:FRIENDS]->(b)
注:
方括号[]即为关系,FRIENDS为关系的类型。
注意这里的箭头-->是有方向的,表示是从a到b的关系。 这样,Liz和Mike之间建立了FRIENDS关系。
- 关系增加属性
MATCH (a:Person {name:'Shawn'}),
(b:Person {name:'Sally'})
MERGE (a)-[:FRIENDS {since:2001}]->(b)
- 增加更多的朋友关系:
MATCH (a:Person {name:'Shawn'}), (b:Person {name:'John'}) MERGE (a)-[:FRIENDS {since:2012}]->(b)
MATCH (a:Person {name:'Mike'}), (b:Person {name:'Shawn'}) MERGE (a)-[:FRIENDS {since:2006}]->(b)
MATCH (a:Person {name:'Sally'}), (b:Person {name:'Steve'}) MERGE (a)-[:FRIENDS {since:2006}]->(b)
MATCH (a:Person {name:'Liz'}), (b:Person {name:'John'}) MERGE (a)-[:MARRIED {since:1998}]->(b)
这样,图谱就已经建立好了:
图 17 图谱
- 建立不同类型节点之间的关系-人物和地点的关系
MATCH (a:Person {name:'John'}), (b:Location {city:'Boston'}) MERGE (a)-[:BORN_IN {year:1978}]->(b)
MATCH (a:Person {name:'Liz'}), (b:Location {city:'Boston'}) MERGE (a)-[:BORN_IN {year:1981}]->(b)
MATCH (a:Person {name:'Mike'}), (b:Location {city:'San Francisco'}) MERGE (a)-[:BORN_IN {year:1960}]->(b)
MATCH (a:Person {name:'Shawn'}), (b:Location {city:'Miami'}) MERGE (a)-[:BORN_IN {year:1960}]->(b)
MATCH (a:Person {name:'Steve'}), (b:Location {city:'Lynn'}) MERGE (a)-[:BORN_IN {year:1970}]->(b)
这里的关系是BORN_IN,表示出生地,同样有一个属性,表示出生年份。
如图 18 ,在人物节点和地区节点之间,人物出生地关系已建立好。
- 创建节点的时候就建好关系
CREATE (a:Person {name:'Todd'})-[r:FRIENDS]->(b:Person {name:'Carlos'})
最终该图谱如下图所示:
图 18 图谱
- 查询下所有在Boston出生的人物
MATCH (a:Person)-[:BORN_IN]->(b:Location {city:'Boston'}) RETURN a,b
结果如图 19:
图 19 查询下所有在Boston出生的人物
- 查询所有对外有关系的节点
MATCH (a)--() RETURN a
结果如图 20:
图 20 查询所有对外有关系的节点
- 查询所有有关系的节点
MATCH (a)-[r]->() RETURN a.name, type(r)
结果如图21:
图 21 查询所有有关系的节点
- 查询所有对外有关系的节点,以及关系类型
MATCH (a)-[r]->() RETURN a.name, type(r)
结果如图22:
图 22 查询所有对外有关系的节点,以及关系类型
- 查询所有有结婚关系的节点
MATCH (n)-[:MARRIED]-() RETURN n
结果如图 23:
图 23 查询所有有结婚关系的节点
- 查找某人的朋友的朋友
MATCH (a:Person {name:'Mike'})-[r1:FRIENDS]-()-[r2:FRIENDS]-(friend_of_a_friend) RETURN friend_of_a_friend.name AS fofName
返回Mike的朋友的朋友,结果如图 24:
图 24 查找某人的朋友的朋友
- 增加/修改节点的属性
MATCH (a:Person {name:'Liz'}) SET a.age=34
MATCH (a:Person {name:'Shawn'}) SET a.age=32
MATCH (a:Person {name:'John'}) SET a.age=44
MATCH (a:Person {name:'Mike'}) SET a.age=25
这里,SET表示修改操作
- 删除节点的属性
MATCH (a:Person {name:'Mike'}) SET a.test='test'
MATCH (a:Person {name:'Mike'}) REMOVE a.test
删除属性操作主要通过REMOVE 3. 删除节点
MATCH (a:Location {city:'Portland'}) DELETE a
删除节点操作是DELETE 4. 删除有关系的节点
MATCH (a:Person {name:'Todd'})-[rel]-(b:Person) DELETE a,b,rel
# step 1:导入 Neo4j 驱动包
from neo4j import GraphDatabase
# step 2:连接 Neo4j 图数据库
driver = GraphDatabase.driver("bolt://localhost:7687", auth=("neo4j", "password"))
# 添加 关系 函数
def add_friend(tx, name, friend_name):
tx.run("MERGE (a:Person {name: $name}) "
"MERGE (a)-[:KNOWS]->(friend:Person {name: $friend_name})",
name=name, friend_name=friend_name)
# 定义 关系函数
def print_friends(tx, name):
for record in tx.run("MATCH (a:Person)-[:KNOWS]->(friend) WHERE a.name = $name "
"RETURN friend.name ORDER BY friend.name", name=name):
print(record["friend.name"])
# step 3:运行
with driver.session() as session:
session.write_transaction(add_friend, "Arthur", "Guinevere")
session.write_transaction(add_friend, "Arthur", "Lancelot")
session.write_transaction(add_friend, "Arthur", "Merlin")
session.read_transaction(print_friends, "Arthur")
上述程序的核心部分,抽象一下就是:
neo4j.GraphDatabase.driver(xxxx).session().write_transaction(函数(含tx.run(CQL语句)))
或者
neo4j.GraphDatabase.driver(xxxx).session().begin_transaction.run(CQL语句)
- 介绍:通过操作python变量,达到操作neo4j的目的
# step 1:导包
from py2neo import Graph, Node, Relationship
# step 2:构建图
g = Graph()
# step 3:创建节点
tx = g.begin()
a = Node("Person", name="Alice")
tx.create(a)
b = Node("Person", name="Bob")
# step 4:创建边
ab = Relationship(a, "KNOWS", b)
# step 5:运行
tx.create(ab)
tx.commit()
py2neo模块符合python的习惯,写着感觉顺畅,其实可以完全不会CQL也能写
- 动机:前面学习的是单个创建节点,不适合大批量导入。这里我们使用neo4j-admin import命令导入,其他导入方法也可以参考Neo4j之导入数据
csv分为两个nodes.csv和relations.csv,注意关系里的起始节点必须是在nodes.csv里能找到的:
# nodes.csv需要指定唯一ID和nam,
headers = [
'unique_id:ID', # 图数据库中节点存储的唯一标识
'name', # 节点展示的名称
'node_type:LABEL', # 节点的类型,比如Person和Location
'property' # 节点的其他属性
]
# relations.csv
headers = [
'unique_id', # 图数据库中关系存储的唯一标识
'begin_node_id:START_ID', # begin_node和end_node的值来自于nodes.csv中节点
'end_node_id:END_ID',
'begin_node_name',
'end_node_name',
'begin_node_type',
'end_node_type',
'relation_type:TYPE', # 关系的类型,比如Friends和Married
'property' # 关系的其他属性
]
制作出两个csv后,通过以下步骤导入neo4j:
- 两个文件nodes.csv ,relas.csv放在
neo4j安装绝对路径/import
- 导入到图数据库mygraph.db
neo4j bin/neo4j-admin import --nodes=/var/lib/neo4j/import/nodes.csv --relationships=/var/lib/neo4j/import/relas.csv --delimiter=^ --database=xinfang*.db
delimiter=^ 指的是csv的分隔符
- 指定neo4j使用哪个数据库
修改 /root/neo4j/conf/neo4j.conf 文件中的 dbms.default_database=mygraph.db
- 重启neo4j就可以看到数据已经导入成功了