README_KR.md

Copy-paste Augmentation for Nodule Detection

English | Korean

프로젝트 소개

해당 프로젝트는 NeurIPS ML4H 2022 참여에 사용된 프로젝트입니다.

의료 데이터의 특징 중 하나는 data imbalanced가 심한 점을 고려하여 의료 영상 데이터의 폐에 존재하는 nodule을 복사 후 Soft Augmentation을 거쳐 정상 영상과 nodule이 존재하는 영상 모두에 최소 1개에서 최대 3개를 붙여 넣어 효과를 확인하고자 하였습니다.

환경 설정

Step 1. Anaconda3를 다운 받고 가상 환경을 생성합니다.

conda create -n env_name python=3.8

Step 2. 필요한 라이브러리를 다운받습니다. (pytorch는 공식 홈페이지를 참조하는 것을 권장합니다.)

conda install --yes --file requirements.txt
conda install pytorch=1.12.0 cudatoolkit=11.3 -c pytorch

Step 3. MMDetection library를 다운받습니다.

pip install openmim
mim install mmcv-full

결과

참여자

김이삭(서울대학교병원 영상의학과, 서울대학교 박사과정)
전경민(서울대학교병원 영상의학과, 단국대학교)
서다빈(서울대학교병원 영상의학과, 고려대학교)
이주환(서울대학교병원 영상의학과, 숭실대학교)

Detection 베이스라인은 MMDetection Library를 이용하였습니다.

참고 문서