生物细胞中的DNA序列里面包含许多重复序列（repeated sequence），主要可分为两大类，分别是串联重复序列（也叫串接重复序列，Tandem repeat）与散在重复序列（Interspersed repeat）。 串联重复和散在重复的区别在于重复的部分是否相邻分布，相邻就是串联重复，不相邻就是散在重复。如：ATGATGATGATG可以看作是关于ATG的串接重复；ATGXATGXXATG可以看作关于ATG的散在重复。两个主要类型又进一步划分为不同的子类型。
- 卫星DNA（Satellite DNA）
卫星DNA由串联排列、不断重复的非编码DNA组成，它是着丝粒的主要组成部分，也是异染色质的主要结构部分。
- 小卫星（Minisatellite）
小卫星DNA是一个基因称呼，又称可变数目串联重复（variable number tandem repeat, VNTR），由15~65bp的基本单位串联而成，总长通常不超过20kb，重复次数在群体中是高度变异的。
- 微卫星（Microsatellite）
微卫星（亦称为简单重复序列（Simple Sequence Repeats，SSRs）或短串联重复序列（英语：short tandem repeats，STRs））是多态性的一种类型。指两个或多个核苷酸重复排列，且不同的重复序列相邻的形式，长度约2到10个碱基对，常见于非编码的内含子中。
- 短散在重复（short interspersed nuclear element；缩写SINE）
以散在方式分布于基因组中的较短的重复序列。重复序列单元长度在50bp以下。
- 长散在重复（long interspersed nuclear element；缩写LINE）
重复序列单元长度在1000bp以上的称为长散在重复序列。
- 长末端重复序列（long terminal repeated，LTR）
长末端重复序列（LTR）：反转录病毒的基因组的两端各有一个长末端重复序列(5'—LTR和3'—LTR)，不编码蛋白质，但含有启动子，增强子等调控元件，病毒基因组内的LTR可转移到细胞原癌基因邻近处，使这些原癌基因在LTR强启动子和增强子的作用下被激活，将正常细胞转化为癌细胞。
是一种DNA序列，它们能够在基因组中通过转录或逆转录，在内切酶（Nuclease）的作用下，在其他基因座上出现。转座子的这种行为，与假基因（Pseudogene）的出现颇有相似甚至相同之处。有些科学家将后者视为“基因化石”，是透视物种进化的痕迹之一。转座子的发现，证明了基因组并不是一个静态的集合，而是一个不断在改变自身构成的动态有机体。根据转座子“跳跃”方式的不同，转座子被分为I型和II型转座子。
- I型转座子(反转录转座子)
I型转座子转座中间体是RNA。I型转座子又被称为逆元件（Retro element）。该型转座子会先被转录为RNA，然后该RNA被逆转录，再次成为DNA，才被插入到目标位点中。
- II型转座子(DNA转座子)
相比起I型转座子的“复制后粘贴”，II型转座子的转座行为就是“剪切后粘贴”。II型转座中间体是DNA，其实就是它本身。因此II型转座子又被称为不复制转座子。这类型的转座子在结构上有其特点。首先是转座子序列的两端，是两段直接重复序列（direct repeat，简称DR），与它们接壤的是反向重复序列（invert repeat，简为IR），就是所谓的“回文”序列。然后才是中间的插入序列（Insert sequence，简为IS）。
