-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 12
Expand file tree
/
Copy pathsam_file.sam
More file actions
54 lines (54 loc) · 6.47 KB
/
sam_file.sam
File metadata and controls
54 lines (54 loc) · 6.47 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
@SQ SN:adi_Scaffold31 LN:614279
@SQ SN:adi_Scaffold55 LN:515483
@SQ SN:adi_Scaffold100 LN:444790
@SQ SN:adi_Scaffold246 LN:315125
1 4 * 0 0 * * 0 0 AAATGTACCAAAGTTTAAAATGCACGTGCGGAGTGATTGTTTTTGTTCAAATGTTGTTGCTGCCGTCGTCGTTGCTTAAGGACGGTGCCTAC * AS:i:0 XS:i:0
2 4 * 0 0 * * 0 0 CGCATTCCTATCGATTGACATCCTCTGCTGCTCTGCGCACTCACCACTTTCTTGCTCGTGTGTAGGCGACGTTGAAGGGAATCGCTGTAGCT * AS:i:0 XS:i:0
3 4 * 0 0 * * 0 0 AAGAAAGCGATAACAATGATGATGACAATGATGGATATGACATTGATTCAGGGTCAGAGGGCGACATAAGTGACGGAGNTGAGAGTGACATC * AS:i:0 XS:i:0
4 4 * 0 0 * * 0 0 AGAACAGTAATTCGCATTTGCTCGAAACACGTGATTAAAGGGGGCACACACAACTCCTAGCATGGTTCCTAGTAGTGTACAATTGTTGAAGT * AS:i:0 XS:i:0
5 4 * 0 0 * * 0 0 GTATGGGTAGTTGTGTTACACATACTAATCAGTGGGATGATGTCGGAGTGAAAAATTTTTGTCGTATTCCATGTTTTGTTGGTGAGGCTAAT * AS:i:0 XS:i:0
6 4 * 0 0 * * 0 0 CACACACTTGCCAATATGAAGAGGTAAGCCTAAACGCTTGCAAACGGCTAATGAAGTACTCAAGTTCTGTGCACGTTGCGGGGAGTCAGGAG * AS:i:0 XS:i:0
7 4 * 0 0 * * 0 0 CAATGAACTGTACACTTGTTCACTACCAGACAACTATCCAGTAATAAGTAAAGAAAGGAGGAAAGTTCTCCTAAGGATTTATGGACCACTCT * AS:i:0 XS:i:0
8 4 * 0 0 * * 0 0 AACAAAAGTGAGTCATCTCCAAGTCTGAAAAAAAATCCATTATGTTATAACTTCTTTTGCAAGCTCATGTTGCAGTTGTGAAACT * AS:i:0 XS:i:0
9 0 adi_Scaffold100 36447 33 35M57S * 0 0 CCATACCCTATCCAGCGGCATGTCCCCGTATAGCCCATGGGAGACGGTGTTAGATATGATTTTTTACGAGCCTGACAGGGGTCCTAACAAGC * NM:i:1 AS:i:30 XS:i:0
10 4 * 0 0 * * 0 0 CAAATGGGATGGAATTGGAAGGACTCAAGCGTTGCTTGGACCACTTTCAAGAAGAAAATGTGACCATTGCAAAACTNTGCAACAGATAGGCAT * AS:i:0 XS:i:0
11 4 * 0 0 * * 0 0 TGATGAATCTCTGGACAAGAAGAAGATGCCGTTTGATTTGAATTGCTGGAAGTCAGCTTCTCCAAAGGTATTTTNCTTCAACTATAAAACTG * AS:i:0 XS:i:0
12 4 * 0 0 * * 0 0 ATGTTACCGGCATTAGTTAAAGAAACATTAACATCAAGGAAAGATACGTTAGTAGAAGAGTGTGAGCTAGTAAATTTAATGGTAGGGTGAAT * AS:i:0 XS:i:0
13 4 * 0 0 * * 0 0 GATGGAATTGACAAAACAGAAAATCTTTTTGCTGGATTCTCCCGGAATTTGTTCCCTATCATTAATTTTTGCGCAAACGTTTTCTCATCAAT * AS:i:0 XS:i:0
14 4 * 0 0 * * 0 0 ACGCGCTGGAACGCCGCTTTCTGACCACAGGCGAACCGCGCGATCTCACGCTGGTCTACTCCGCCGGACAGGGCGATCGCGCTACGCGCGGC * AS:i:0 XS:i:0
15 4 * 0 0 * * 0 0 GCTTCGAAAAGTTTTCGTTTAAGGTGGCCGAACACAGTTTGCGTGNGCTTAACAAGTTCATTCTTTTAATGATGATAGTANNCC * AS:i:0 XS:i:0
16 4 * 0 0 * * 0 0 AACATCTTCGAACTATAACTAACGAACCACAAACCAACTAAACTAATCTTATGGCCCATCTAAGCAGCAGTATCTTGAATATTTACCNNGT * AS:i:0 XS:i:0
17 4 * 0 0 * * 0 0 AGGAAACGACGATCTGCAGTCTCTCTTCCTCACCCATCGCGTACGCTGCCTGTGATTTTGGTTTACTTACTTCTTACGAGTGTGCGCATATG * AS:i:0 XS:i:0
18 4 * 0 0 * * 0 0 TCGTTTACACAATTTACATCTTAATCGCCCATACTTCTTCCGTAAAAAACACGAGTAAACATACCTTTGATTTGATTTAGCGTTATCTGAAG * AS:i:0 XS:i:0
19 4 * 0 0 * * 0 0 CAAAATCATTGTCGCATCAAGAACAAAACGACAAGTGCAACAGCGAAAAGATTAACGACTTGTGACGTCATCAGGTAAGGTGAGCAGCTTTT * AS:i:0 XS:i:0
20 4 * 0 0 * * 0 0 GAGGGATGGCGATGTGTGCCTCCTGCCAATGTTATGTTACTTCGGGGCATCGCTTACCCGAGATGCAAGAGCCGGAAGAAGATATGCTNNNN * AS:i:0 XS:i:0
21 4 * 0 0 * * 0 0 ACATATTGCCACCATGAGACTTGCTCTTATTTTCGTCACTCAGCTCTCTAAGTTTCATTAGCCGCGTGTGCTCCTCTTCCTACAATAAATAA * AS:i:0 XS:i:0
22 4 * 0 0 * * 0 0 GTCTCCATGGCAAGTACGCAGACAACTGCGATTGCGAGATCCGTTTTTGTATTCCAGGATATCACTGCAAAATGGTTCAGTCCTCTTTACCT * AS:i:0 XS:i:0
23 4 * 0 0 * * 0 0 AAATGTACCAAAATGTAAAACGCACGTGCAGAGCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTAGGCATGATCTCGTATGCCGTCTT * AS:i:0 XS:i:0
24 4 * 0 0 * * 0 0 GAGTTTCCTCCGTATCATCATTTACTTNANTACACCCCACACGATGCCATCATTAGTNATGATTGGGTGAAAAATTTTTGGTGTTGGA * AS:i:0 XS:i:0
25 4 * 0 0 * * 0 0 ACTCATTTCTTTCGCATCGCACGCAAATATCACACATTACAGAGCGCGTTTTGCAGGCATCAAAAACAACACTTTTTGTGAAGTTTGAATTG * AS:i:0 XS:i:0
26 4 * 0 0 * * 0 0 TCAAGTTTCTGAGCNCTTGTTGNGCCAACCNNCCGCCAGCAAACGTTTCAAACCACTGTAACCTGCNTCTGAGTTTTTCAGCTTCCTTCAAG * AS:i:0 XS:i:0
27 0 adi_Scaffold55 236860 0 37M55S * 0 0 ACGGTATTCTGTCTGTTGCAGAGGGGAAATTTAGAGACATTTATCTTGTAGTTTAACAGGTATTTGTCATACTTCTGCTAAACTATCGAGGC * NM:i:1 AS:i:34 XS:i:34
28 4 * 0 0 * * 0 0 CTGANTGAAGAAGTTCTACATGTTTTATATTGNTTGGAAAANTTTTGAGTTACTGAGCCTGGCAGGGGGAGGGGGGAANTGATCCCCTCTTG * AS:i:0 XS:i:0
29 4 * 0 0 * * 0 0 CCATGAGGGTGTTGAGTTCAAAGACCATCTGCTTATCTGTGCAAGNTTTTCCTGTTCTGGGTTGGCGTTGAAGTNAGGCCANTCCCANGTNG * AS:i:0 XS:i:0
30 4 * 0 0 * * 0 0 ACCTAGACGATGGTGTTATCTAAAAGATAAGTAATTGGTTTAAAGTAGGTTTTTAGACAGCGATCCACTTGAAAATAGGCTGTCTTAAAANN * AS:i:0 XS:i:0
31 4 * 0 0 * * 0 0 TCATGGTTGGGTTTTGGTTTGTATAAGTAAGCATGCAGGATGGACTCTATAGTTGTGTCGTATGAATGCTGTTGCAATCTGATAATTCCGTC * AS:i:0 XS:i:0
32 4 * 0 0 * * 0 0 AAATAAGCTATAAACTAAGTTAGCACCAAAGAGTCCTGCTGATGATTTATTCCTTGATTTCTTACCTAATGCCTGAATTTCAGAACTTGCGT * AS:i:0 XS:i:0
33 0 adi_Scaffold246 182085 60 92M * 0 0 ACTCAAGAGCACGGGTAAAAATACCAGTCCGTGAAACGCTCCAATCAAAACTACTCCGAGATACATGCGAAAGTAGAACACCTAAGCCAAAA * NM:i:8 AS:i:59 XS:i:0
34 4 * 0 0 * * 0 0 TAAGCCACCAGCATCCTTTGCAACTCGCTAGTAGAAGGAGAATGAAACAACGGCAAGCTAAGATGTTGCCATTCCTGACAGCTTCACTGTCA * AS:i:0 XS:i:0
35 4 * 0 0 * * 0 0 AGGTATGTAAACAAACATGAAACGATCGAAACGCGCCAAAACAGTCAAACGTCTGGAACGTTTGAAACGCTTGTTTTCAGACGTTTCAAACG * AS:i:0 XS:i:0
36 4 * 0 0 * * 0 0 GTCGAGATTGGGTCTTTGGCTTCACATCGTGGAATCTCCTTTTCCGGTCTTCATTAAACCTATCACGCACAACAGATGCGTACTCCCGCATG * AS:i:0 XS:i:0
37 4 * 0 0 * * 0 0 ATGATGAATGGCGACGCGATGAATGCCAATCCCATGCACAACGCGAAGATGAAATTCTGCTCCATCGCGAAGGCGCAGTAGGATTTCCCCGC * AS:i:0 XS:i:0
38 4 * 0 0 * * 0 0 GGTCCCTGAATGAAAGGAATGGCCAGATAGCAAACCTTCAACAGAAGATAGAAGAGATTGCAAATAGGCCTCCTCCCCCGCCGCCACCTAGA * AS:i:0 XS:i:0
39 4 * 0 0 * * 0 0 GGGGTGGCATGGGGTACACAGGGACAGTAACAGAAGTGGAGATCAGGGTGTTAGCTACTGCTTCCATGAAATATCCCTGCCTGGGGGTTTAGG * AS:i:0 XS:i:0
40 16 adi_Scaffold31 507710 6 17S67M8S * 0 0 ATCGTAACCTTCTCTCCCAGGTTGTAATAACGGAGTATCGGTGACATGGACACAGCTTCTTTGAGTTGCTCAAATGCTCTCTCTTGGGGCTC * NM:i:4 AS:i:47 XS:i:43
41 4 * 0 0 * * 0 0 AATTATTTAGTCCACTTAAATGGGGACAAGAACATACCTTTCTTAACATTTACATCGAATTCACAGTCCATTTGAAGTAGATACGGCATGGC * AS:i:0 XS:i:0
42 4 * 0 0 * * 0 0 CAAATTAAGTCGACAGACTAATTTTCTTGCTCTGCGTTAAGACACAAGGCTTTATTAATTTTCCTGTCAAGATTTAGTGAATAAATTATGCA * AS:i:0 XS:i:0
43 4 * 0 0 * * 0 0 CGAGTTGTAATTTGTTACGCACTGCAACAATTATCGCATCGCATTAAGATCGGGGAAAATTCGGCGTCGCTATAAGAGGTAGAGTGCGAACA * AS:i:0 XS:i:0
44 4 * 0 0 * * 0 0 GTCCCGTCGATACTTACTTTGATGGTAAAAAGTGCGTAAATCTTACAGAGAAGTGCAGCAGGCCTTGTGTCGTCAGCCCAACAACCTCTGTC * AS:i:0 XS:i:0
45 4 * 0 0 * * 0 0 TCTATTATGGACTGTACATCCACTCCTTTTCCCCCTTGTTTCTCCTTCTGTTCCTGGTTAGTGCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCAC * AS:i:0 XS:i:0
46 4 * 0 0 * * 0 0 TTATATCGCTGATAAGGCAGTGGAAAAATGGAAAATTGTTTATGGCTAAGATAAGGAGAATTTTCCTGTGGGGAAAATCTTAAACNNCT * AS:i:0 XS:i:0
47 4 * 0 0 * * 0 0 GAACAGGAAGCTGGGACGGAGGGGACGGAGGGACGGAGAGCGAATCCGGGATATTCATTTCGAGGTTGAAGAAGAAGAATATTTGGCTGCG * AS:i:0 XS:i:0
48 4 * 0 0 * * 0 0 TAGGGAACGCTACACTTGACCAACAAAGCGGACTACTCCAAATGCAAATGAATGCTGTTTATAAACTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCC * AS:i:0 XS:i:0
49 4 * 0 0 * * 0 0 TCGGTATTAGGCACGCGCCCGACGGCCATCAGCAAATGCGAGCCGGATACCTCGCGCGCGCCGCTGCCGCACTCCAGGCCGACCACGACGTT * AS:i:0 XS:i:0
50 4 * 0 0 * * 0 0 GCTGCTCCCTTCGCAGTTCNGTCGTCATCCGTAGCATNTGCGCCAACGTCTGACNTTCCACCATGCTTTGNTGCTGCGGCGGTCGCTGCACT * AS:i:0 XS:i:0