Repositório de dados

Programa de Pós-Graduação em Etnobiologia e Conservação da Natureza

Nome da disciplina: Introdução ao geoprocessamento para Etnobiologia e Conservação da Biodiversidade

Docente responsável
Prof. Thiago Gonçalves Souza

Docente externo convidado
Prof. Maurício Vancine (UNESP - Rio Claro)

Período
30/09/2019 - 04/10/2019

Créditos
45 horas (3 créditos)

Vagas
15 + 5 especiais

Resumo
A disciplina oferecerá os principais conceitos teórico-práticos introdutórios de geoprocessamento aplicado à Ecologia. A parte prática será desenvolvida através de ferramentas na linguagem R e do software QGIS. Serão abordados os seguintes temas: (i) controle de versão, Git e GitHub, (ii) introdução e funcionamento da linguagem R e do software RStudio, (iii) estrutura e manejo de dados na linguagem R, (iv) introdução ao tidyverse, (v) visualização de dados, (vi) estrutura e fonte de dados geoespaciais, (vii) introdução e funcionamento do software QGIS, e (viii) estrutura e manejo de dados geoespaciais na linguagem R. A carga horária total será de 45 horas, onde nos cinco dias iniciais serão ministrados 6 horas teóricas-práticas, num total de 30 horas. As 15 horas restantes serão direcionadas à realização de exercícios práticos, que serão aplicados remotamente como forma de avaliação para compor a nota final da disciplina. Após a realização da disciplina, espera-se que os alunos adquiram conceitos gerais da estrutura e manipulação de dados espaciais, assim como domínio das técnicas e métodos para alcançar autonomia e produzir soluções para suas próprias questões relativas ao geoprocessamento.

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Informações aos participantes

Datas e horários
Teórico-prático: 30/09 – 04/10 [09:00 h - 12:00 h | 14:00 h - 17:00 h] (30 horas)
Exercícios-atividades assistidas remotamente: 07/09 – 11/09 (15 horas)

Local

Ementa
pdf

Contato
Para mais informações ou dúvidas, envie e-mail para Maurício Vancine (mauricio.vancine@gmail.com)

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Instruções aos participantes

Hardware
Será necessário que todos tragam seus próprios notebooks

Softwares
R, RStudio e QGIS

1. Instalar a versão mais recente do R (3.6.1) e RStudio (1.2.5001)
   Vídeo de instalação do R e do RStudio
   Curso da linguagem R

2. Instalar a versão mais estável do QGIS (3.4 LTR)
   Vídeo de instalação do QGIS
   Curso Básico de QGIS
   Curso de QGIS 3.6 - MasterGIS

3. Instalar o git
   Vídeo de instalação do git
   

Linux (Ubuntu e Linux Mint)

# r
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
echo -e "\ndeb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/" | sudo tee -a /etc/apt/sources.list
sudo apt update
sudo apt install -y r-base-core # r
sudo apt install -y r-base-dev # devtools
sudo apt install -y libssl-dev # tidyverse
sudo apt install -y libxml2-dev # tidyverse
sudo apt install -y libcurl4-openssl-dev # tidyverse
sudo apt install -y libgdal-dev # gdal
sudo apt install -y libproj-dev # gdal
sudo apt install -y libudunits2-dev # units

# rstudio
wget -c https://download1.rstudio.org/desktop/trusty/amd64/rstudio-1.2.5033-amd64.deb
sudo dpkg -i rstudio-1.2.5033-amd64.deb
sudo apt install -fy
rm rstudio-1.2.5033-amd64.deb

# qgis
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key 51F523511C7028C3
echo -e "\ndeb https://qgis.org/ubuntu bionic main" | sudo tee -a /etc/apt/sources.list
sudo apt update
sudo apt install -y qgis qgis-plugin-grass saga

# git
sudo add-apt-repository ppa:git-core/ppa && sudo apt update
sudo apt install -y git

Instalar os pacotes no R
Com o R e o RStudio instalados, baixe esse script (scripts são roteiros que possuem comandos, como um rascunho).
Abra o script baixado (script_install_packages.R) no software RStudio e rode cada linha de comando para instalar os pacotes.
Para rodar as linhas, basta colocar o cursor na linha de código a ser executada e precionar: Crtl + Enter, como mostra o gif abaixo: