Merge pull request #1 from broadinstitute/dp

restore missing test input files

Author: dpark01

.travis.yml

@@ -8,10 +8,8 @@ env:
   global:
   - CACHE_DIR="$HOME/misc_cache"
   - MINICONDA_DIR="$HOME/miniconda"
-  - PIP_DIR="$HOME/virtualenv"
   - GATK_PATH="$CACHE_DIR"
   - PYTHONIOENCODING=UTF8
-  - PYTEST_ADDOPTS="-rsxX -n 2 --durations=25 --fixture-durations=10 --junit-xml=pytest.xml --cov-report= --cov broad_utils --cov illumina --cov assembly --cov interhost --cov intrahost --cov metagenomics --cov ncbi --cov read_utils --cov kmer_utils --cov reports --cov taxon_filter --cov tools --cov util --cov file_utils"
 
   - DOCKER_REGISTRY="quay.io"
   - DOCKER_REPO_PROD="quay.io/broadinstitute/micro-readqc"
@@ -85,6 +83,7 @@ jobs:
       stage: test
       env:
         - TRAVIS_JOB=test_py36_in_docker
+        - PYTEST_ADDOPTS="-rsxX -n 2 --durations=25 --fixture-durations=10 --junit-xml=pytest.xml --cov-report= --cov broad_utils --cov illumina --cov read_utils --cov reports --cov tools --cov util --cov file_utils"
       install:
         - DOCKER_TAG=`travis/list-docker-tags.sh | tail -1`
         - docker pull $DOCKER_TAG