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PORTUGUÊS (Usando a codificação ISO) ===================
AMBIENTE COMPUTACIONAL NECESSÁRIO PARA O INLAND/IBIS
- Sistema operacional UNIX ou compatível
- Compiladores: GNU gfortran, PGI pgf90 ou Intel ifort
- Preprocessador C (GNU cpp ou compatível)
- Bibliotecas NetCDF: Deverão ser instaladas com o mesmo compilador que será utlizado para a compilação do modelo. Maiores informações:http://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf
DIRETÓRIOS DO INLAND/IBIS
inland
|---contrib Contribuições de desenvolvedores, não utilizados durante a execução do modelo.
|---docs Descritivos e manuais do código.
|---src Código fonte do modelo.
|---include Parâmetros utilizados em tempo de compilação.
|---data
|---offline
|---grid Arquivos e Parâmetros para simulações GRID.
| |---input Condições de contorno e forçantes atmosféricas.
| |---params Arquivos de parâmetros no dossel, vegetação, solo e fogo.
| |---conf Arquivos de configuração de execução.
| |---output Arquivos de output do modelo.
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|---single_point Arquivos e Parâmetros para simulações SINGLE POINT.
|---input Condições de contorno e forçantes atmosféricas.
|---params Arquivos de parâmetros no dossel, vegetação, solo e fogo.
|---conf Arquivos de configuração de execução.
|---output Arquivos de output do modelo.
INSTALAÇÃO e EXECUÇÃO do INLAND/IBIS - GRID
A partir do diretório raiz do modelo execute:
'./configure' - Instalação do ambiente de compilação.
'make dev-symlinks' - Compilação do modelo
'./inland-grid' - Execução do modelo
OBSERVAÇÃO:
Para alterar o compilador
'FC=<compilador> ./configure'
ex.: 'FC=gfortran ./configure'
Arquivos saída do modelo se encontram em 'output/' no seguinte formato:
'inland-daily-YYYY.nc' - output diária
'inland-monthly-YYYY.nc' - output mensal
'inland-yearly-YYYY.nc' - output anual
onde 'YYYY' é a identificação do ano
No final de cada ano simulado são criados, no diretório 'output/', arquivos de restart e de diagnóstico.
INSTALAÇÃO e EXECUÇÃO do INLAND/IBIS - SINGLE POINT
A partir do diretório raiz do modelo execute:
'./configure --enable-single_point' - Instalação do ambiente de compilação.
'make dev-symlinks' - Compilação do modelo
'./inland-single_point' - Execução do modelo
OBSERVAÇÃO:
Para alterar o compilador
'FC=<compilador> ./configure --enable-single_point'
ex.: 'FC=gfortran ./configure --enable-single_point'
Arquivos saída: do modelo se encontram em 'output/' como
'single_point-output.csv'
OUTROS PONTOS IMPORTANTES
1) Parâmetros de configuração da simulação
1.1) Valores default serão usadas por variaveis ausentes, com exeção de valores de latitude/longitude.
1.2) Para simulações em GRID o 'inland-grid.infile', encontrado em 'data/offline/grid/conf'
! temporal parameters
irestart = 0 , ! irestart - 0: not a restart run 1: restart run (default 0)
iyrrestart = 9999 , ! iyrrestart - year to restart model (default 9999)
iyear0 = 1981 , ! iyear0 - initial year of simulation (don't change for restart) (default 1981)
nrun = 2 , ! nrun - number of years in this simulation (change for restart) (default 2)
iyrdaily = 9999 , ! iyrdaily - year to start reading daily data (ditto) (default 9999)
iyrmon = 9999 , ! iyrmon - year to start reading montly data (default 9999)
dtime = 3600 , ! dtime - time step in seconds (default 3600)
!
! simulation parameters
soilcspin = 0 , ! soilcspin - 0: no soil spinup, 1: acceleration procedure used (default 0)
isimveg = 0 , ! isimveg - 0: static veg, 1: dynamic veg, 2: dynamic veg-cold start (default 0)
isimfire = 1 , ! 0: no fire disturbance (0%/yr), 1: natural const (0.5%/yr), 2: CTEM, 3: IBIS (default 1, ignored if isimveg=0)
isimco2 = 0 , ! isimco2 - 0: fixed co2, 1: ramped co2 (default 0)
co2init = 0.000350 , ! co2init - initial co2 concentration in mol/mol (real) (default 0.000350)
o2init = 0.209000 , ! o2init - initial o2 concentration in mol/mol (real) (default 0.209000)
!
! output parameters
iyearout = 1 , ! iyearout - 0: no yearly output, 1: yearly output (default 1)
imonthout = 1 , ! imonthout - 0: no monthly output, 1: monthly output (default 1)
idailyout = 0 , ! idailyout - 0: no daily output, 1: daily output (default 0)
idiag = 0 , ! idiag - 0: no diagnostic output, 1-10 # of files to output (default 0)
!
! domain parameters
snorth = 5.0 , ! snorth - northern latitude for subsetting in/output (no default)
ssouth = -15.0 , ! ssouth - southern latitude for subsetting in/output (no default)
swest = -75.0 , ! swest - western longitude for subsetting in/output (no default)
seast = -55.0 ! seast - eastern longitude for subsetting in/output (no default)
1.3) Para simulações em modo SINGLE POINT o 'inland-single_point.infile', encontrado em 'data/offline/single_point/conf'
irestart = 0 , ! irestart 0: not a restart run 1: restart run (default 0)
iyear0 = 1992 , ! iyear0 initial year of simulation (don't change for restart) (default 1981)
nrun = 12 , ! nrun number of years in this simulation (change for restart) (default 2)
iyrdaily = 9999 , ! iyrdaily year to start reading daily data (ditto) (default 9999)
dtime = 3600 , ! dtime time step in seconds (default 3600)
!
! simulation parameters
soilcspin = 0 , ! soilcspin 0: no soil spinup, 1: acceleration procedure used (default 0)
isimveg = 1 , ! isimveg 0: static veg, 1: dynamic veg, 2: dynamic veg-cold start (default 1)
isimfire = 1 , ! 0: no fire disturbance (0%/yr), 1: natural const (0.5%/yr), 2: CTEM, 3: IBIS (default 1, ignored if isimveg=0)
isoilforc = 0 , ! isoilforc 0: dynamic soil physics 1: forced soil physics (default 0)
isimco2 = 0 , ! isimco2 0: fixed co2, 1: ramped co2 (default 0)
co2init = 0.000350 , ! co2init initial co2 concentration in mol/mol (real) (default 0.000350)
o2init = 0.209000 , ! o2init initial o2 concentration in mol/mol (real) (default 0.209000)
!
! output parameters
iyearout = 0 , ! iyearout 0: no yearly output, 1: yearly output (default 0)
imonthout = 0 , ! imonthout 0: no monthly output, 1: monthly output (default 0)
idailyout = 0 , ! idailyout 0: no daily output, 1: daily output (default 0)
idiag = 0 , ! idiag 0: no diagnostic output, 1-10 # of files to output (default 0)
!
! domain parameters
snorth = -3.05 , ! snorth northern latitude for subsetting in/output (no default)
ssouth = -9.83 , ! ssouth southern latitude for subsetting in/output (no default)
swest = -54.98 , ! swest western longitude for subsetting in/output (no default)
seast = -54.85 ! seast eastern longitude for subsetting in/output (no default)
2) Para maiores informações sobre './configure' digite: './configure -help'
3) O arquivo 'config.log', gerado no diretório raiz do modelo após a execução do './configure', apresenta informações do ambiente computacional em que foi executado. Este arquivo ajuda a identificar possíveis erros na instalação.
4) Para remover executável e arquivos compilados,
4.1) 'make clean', para remover os arquivos binarios e o arquivo de execução.
5) Para reiniciar uma simulação em modo GRID, utilizando o 'restart', é necessário realizar alterações no 'inland.infile' encontrado no diretório 'conf'
5.1) Alterar para '1' o parâmetro 'irestart'.
5.2) Alterar o parâmetro 'iyrrestart' para o ano desejado.
5.3) Alterar o valor do parâmetro 'nrun' para o número de anos que faltavam para terminar a simulação quando ela foi interrompida.
5.4) Após estas alterações, executar o modelo.
5.5) Importante:
5.5.1) O restart só funciona com a vegetação dinâmica ativa (parâmetros 'isemveg' igual a '1' ou '2')
5.5.2) O restart inicia a partir do último ano encontrado nos arquivos de saída
5.5.3) O restart não funciona caso o código seja recompilado
5.5.4) O restart não funciona para simulações 'single-point'
6) Simulações em modo 'single-point':
6.1) Os dados de entrada devem ser utilizados no horário local da torre.
6.2) Para alterar o sitio de simulação:
Sitios disponibilizados:
- Santarem Km67 (k67)
- Santarem Km83 (k83)
- Manaus Km34 (k34)
- Reserva Jaru (rja)
6.2.1) Alterar o nome do arquivo de input do sitio para clim-input
Diretorio: inland/data/offline/single_point/input
Ex: cp clim-input-k67 clim-input
6.2.2) Alterar o nome do arquivo de paramentro (single_point_parameters) para o sitio desejado
Diretorio: inland/data/offline/single_point/params
Ex: cp single_point_parameters_k67 single_point_parameters
6.2.3) Fazer as alteracoes solicitadas no arquivo docs/parameters_single_point.txt para o sitio desejado