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Exact Cover Parallel

Parallélisation d'un solver du problème de couverture exacte.

Répertoires

  • sequential : programme séquentiel
  • openmp : parallélisation avec OpenMP
  • mpi : parallélisation avec MPI
  • hybrid : parallélisation avec MPI et OpenMP
  • checkpointing : parallélisation avec checkpointing
  • instances : instances du problème de couverture exacte
  • benchmark : scripts en Python pour lancer des benchmarks et visualiser les résultats, fichiers de configuration (json) et fichiers de résultats (csv, png)

Compilation

  • Compiler un seul programme : aller dans un répertoire et entrer make
  • Compiler tous les programmes : entrer make à la racine du répertoire
  • Supprimer un exécutable : entrer make clean dans un répertoire
  • Supprimer tous les exécutables : entrer make clean à la racine du répertoire

Versions

Voici les différentes versions du solver du problème de couverture exacte.

Séquentielle

  • Répertoire : sequential
  • Programme : exact_cover.c
./exact_cover.out --in ../instances/bell13.ec

Parallèle avec OpenMP

  • Répertoire : openmp
  • Programmes :
    • exact_cover_omp_bfs.c
    • exact_cover_omp_tasks.c
./exact_cover_omp_bfs.out --in ../instances/bell13.ec

Parallèle avec MPI

  • Répertoire : mpi
  • Programmes :
    • exact_cover_mpi_bfs.c
    • exact_cover_mpi_dynamic.c
    • exact_cover_mpi_static.c

En local (pour tester) :

mpirun -n 4 ./exact_cover_mpi_bfs.out --in ../instances/bell13.ec

Sur Grid5000 (avec un processus par coeur) :

mpirun --map-by ppr:1:core --hostfile $OAR_NODEFILE ./exact_cover_mpi_bfs.out --in ../instances/bell13.ec

Parallèle hybride MPI + OpenMP

  • Répertoire : hybrid
  • Programmes :
    • exact_cover_hybrid_bfs.c
    • exact_cover_hybrid_tasks.c

En local (pour tester) :

mpirun -x OMP_NUM_THREADS=2 -n 4 ./exact_cover_hybrid_bfs.out --in ../instances/bell13.ec

Sur Grid5000 (avec un processus par noeud) :

mpirun --map-by ppr:1:node --hostfile $OAR_NODEFILE ./exact_cover_hybrid_bfs.out --in ../instances/bell13.ec

Parallèle avec checkpointing

  • Répertoire : checkpointing
  • Programmes :
    • exact_cover_hybrid_cp.c
    • exact_cover_mpi_cp.c

Auteur

Quentin Deschamps