JGDAS_ATMOS_VERFRAD

#! /usr/bin/env bash

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# Set up environment for GDAS Radiance Monitor job
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source "$HOMEgfs/ush/preamble.sh"

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# Specify NET, RUN, and COMPONENT name
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export NET=${NET:-gfs}
export RUN=${RUN:-gdas}
export COMPONENT=${COMPONENT:-atmos}

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# obtain unique process id (pid) and make temp directories
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export pid=$$
export outid=${outid:-"LL$job"}
export RAD_DATA_IN=${RAD_DATA_IN:-${DATAROOT}/${jobid:?}}

export RADMON_SUFFIX=${RADMON_SUFFIX:-${RUN}}
export CYCLE_INTERVAL=${CYCLE_INTERVAL:-6}

mkdir -p $RAD_DATA_IN
cd $RAD_DATA_IN

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# Determine Job Output Name on System
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export pgmout="OUTPUT.${pid}"
export pgmerr=errfile
export cycle=t${cyc}z

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# Specify Execution Areas
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export HOMEgfs=${HOMEgfs:-${NWROOT}/gfs.${gfs_ver}}
export SCRgfs=${SCRgfs:-$HOMEgfs/scripts}

export FIXgdas=${FIXgdas:-$HOMEgfs/fix/gdas}
export PARMmon=${PARMmon:-$HOMEgfs/parm/mon}

export HOMEradmon=${HOMEradmon:-${HOMEgfs}}
export EXECradmon=${EXECradmon:-$HOMEradmon/exec}
export FIXradmon=${FIXradmon:-${FIXgfs}}
export USHradmon=${USHradmon:-$HOMEradmon/ush}


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# source the parm file
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parm_file=${parm_file:-${PARMmon}/da_mon.parm}
.  ${parm_file}


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# Run setpdy and initialize PDY variables
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if [[ $MY_MACHINE != "HERA" && $MY_MACHINE != "hera" ]]; then
   setpdy.sh
   . ./PDY
fi   

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#  determine PDY and cyc for previous cycle
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cdate=$(${NDATE} -6 ${PDY}${cyc})
echo 'pdate = ${pdate}'

export P_PDY=$(echo ${cdate} | cut -c1-8)
export p_cyc=$(echo ${cdate} | cut -c9-10)

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# COMOUT - WHERE GSI OUTPUT RESIDES
# TANKverf - WHERE OUTPUT DATA WILL RESIDE
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export TANKverf=${TANKverf:-$(compath.py ${envir}/${NET}/${gfs_ver})}
export TANKverf_rad=${TANKverf_rad:-${TANKverf}/${RUN}.${PDY}/${cyc}/$COMPONENT/radmon}
export TANKverf_radM1=${TANKverf_radM1:-${TANKverf}/${RUN}.${P_PDY}/${p_cyc}/$COMPONENT/radmon}
export COM_IN=${COM_IN:-$(compath.py ${envir}/${NET}/${gfs_ver})}
export COMIN=${COMIN:-${COM_IN}/${RUN}.${PDY}/${cyc}/$COMPONENT}

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#  backwards compatibility for
#  gfs v15 which doesn't have 
#  a $COMPONENT in output path 
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if [[ ! -d ${COMIN} ]]; then
   export COMIN=${COM_IN}/${RUN}.${PDY}/${cyc}
fi


mkdir -p -m 775 $TANKverf_rad

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# Set necessary environment variables
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export RAD_AREA=${RAD_AREA:-glb}

export biascr=${biascr:-$COMIN/gdas.t${cyc}z.abias}
export radstat=${radstat:-$COMIN/gdas.t${cyc}z.radstat}

echo " "
echo "JOB HAS STARTED"
echo " "


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# Execute the script.
${RADMONSH:-${SCRgfs}/exgdas_atmos_verfrad.sh} ${PDY} ${cyc}
err=$?

if [[ $err -ne 0 ]] ; then
   exit $err
else
   echo " "
   echo "JOB HAS COMPLETED NORMALLY"
   echo " "
fi

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# Remove the Working Directory
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KEEPDATA=${KEEPDATA:-YES}
cd $DATAROOT
if [ ${KEEPDATA} = NO ] ; then 
  rm -rf $RAD_DATA_IN
fi