JGLOBAL_ATMOS_TROPCY_QC_RELOC

#! /usr/bin/env bash

source "$HOMEgfs/ush/preamble.sh"

export RUN_ENVIR=${RUN_ENVIR:-"nco"}

#############################
# Source relevant config files
#############################
configs="base prep"
export EXPDIR=${EXPDIR:-$HOMEgfs/parm/config}
config_path=${EXPDIR:-$NWROOT/gfs.${gfs_ver}/parm/config}
for config in $configs; do
    . $config_path/config.$config
    status=$?
    [[ $status -ne 0 ]] && exit $status
done


##########################################
# Source machine runtime environment
##########################################
. $HOMEgfs/env/${machine}.env prep
status=$?
[[ $status -ne 0 ]] && exit $status


##############################################
# Obtain unique process id (pid) and make temp directory
##############################################
export pid=${pid:-$$}
export outid=${outid:-"LL$job"}
export DATA=${DATA:-${DATAROOT}/${jobid:?}}
mkdir -p $DATA
cd $DATA


##############################################
# Run setpdy and initialize PDY variables
##############################################
export cycle="t${cyc}z"
setpdy.sh
. ./PDY


##############################################
# Determine Job Output Name on System
##############################################
export pgmout="OUTPUT.${pid}"
export pgmerr=errfile


##############################################
# Set variables used in the exglobal script
##############################################
export CDATE=${CDATE:-${PDY}${cyc}}
export CDUMP=${CDUMP:-${RUN:-"gfs"}}
export COMPONENT=${COMPONENT:-atmos}
if [ $RUN_ENVIR = "nco" ]; then
    export ROTDIR=${COMROOT:?}/$NET/$envir
fi


##############################################
# Begin JOB SPECIFIC work
##############################################

export PROCESS_TROPCY=${PROCESS_TROPCY:-YES}    # Turn on tropical cyclone tcvitals QC proc. if YES
export DO_RELOCATE=${DO_RELOCATE:-NO}           # Turn on tropical cyclone relocation proc. if YES


export tmmark=tm00
if [ $RUN_ENVIR = "nco" ]; then
    export ARCHSYND=$COMROOTp3/gfs/${envir}/syndat     # this location is unique, do not change
else
    export ARCHSYND=${ROTDIR}/syndat   
fi
if [ ! -d ${ARCHSYND} ]; then mkdir -p $ARCHSYND; fi

export HOMENHCp1=${HOMENHCp1:-/gpfs/?p1/nhc/save/guidance/storm-data/ncep}
export HOMENHC=${HOMENHC:-/gpfs/dell2/nhc/save/guidance/storm-data/ncep}

# JY export TANK_TROPCY=${TANK_TROPCY:-${DCOMROOT}/${envir}}   # path to tropical cyclone record database
export TANK_TROPCY=${TANK_TROPCY:-${DCOMROOT}/prod}   # path to tropical cyclone record database


##############################################
# Define COM directories
##############################################
export COMIN=${ROTDIR}/${RUN}.${PDY}/${cyc}/$COMPONENT
export COMOUT=${ROTDIR}/${RUN}.${PDY}/${cyc}/$COMPONENT
if [ ! -d ${COMOUT} ]; then mkdir -p $COMOUT; fi
#export COMINgdas=${ROTDIR}/gdas.${PDY}/${cyc}
#export COMINgfs=${ROTDIR}/gfs.${PDY}/${cyc}

export CRES=$(echo $CASE | cut -c2-)
export LATB=$((CRES*2))
export LONB=$((CRES*4))
export BKGFREQ=1                                # for hourly relocation


##############################################
# Run relevant script
##############################################

${TROPCYQCRELOSH:-$SCRgfs/exglobal_atmos_tropcy_qc_reloc.sh}
status=$?
[[ $status -ne 0 ]] && exit $status


##############################################
# Final processing
##############################################
if [ -e "$pgmout" ] ; then
  cat $pgmout
fi

##########################################
# Remove the Temporary working directory
##########################################
cd $DATAROOT
[[ $KEEPDATA = "NO" ]] && rm -rf $DATA


exit 0