Zebrafish-Analyzing

資料讀取格式

1. read_data.m 檔要確認讀取的 .txt 檔裡面的資料格式，並確認是放置幾個關節點。
2. coordi 變數存取的資料格式為 <頭部, 身體1, 身體2, 尾部>, 其他為 <中心點, Contour, curve_rate, 尾部AUC面積>。(此為 4 點的資料格式)
3. coordi 變數存取的資料格式為 <頭部, 身體中心點, 尾部, Contour, curve_rate, 尾部 AUC 面積>。(此為3點的資料格式)
4. 舊版的讀取格式為 .csv

提取運動特徵

1. 將 coordi 變數輸入至 extract_feature 函數，並設置好參數，其中 boolean 值為是否要存下 time series 圖片。
2. 共有 4 種模式如下:

【1:多個點隨時間變化的角度】【2:兩點前後Frame角度隨時間的變化】【3:每三個Frames計算單點角度隨時間的角度變化】【4:與XY軸的夾角】【5:EXIT】

1範例: 角度範圍組【1:頭】【2:身體】【3:身體2】【4:尾部】(範例:12),角度範圍組【1:頭】【2:身體】【3:身體2】【4:尾部】(範例:34)
2範例: 角度範圍組【1:頭】【2:身體】【3:身體2】【4:尾部】(範例:12) 輸入兩次
3範例: 角度範圍組【1:頭】【2:身體】【3:身體2】【4:尾部】(範例:1)

3. 輸出為 ori_data 為夾角，seq_var 夾角差。
4. 軌跡由 trajectory.m 繪製。
5. 距離、速度由 Distance.m 計算。(注意: 影片的幀數、解析度大小)
6. evaluate.m 包含了 Approximate entropy、Multiscale entropy計算，輸入為先前所得到的 ori_data、seq_var。