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29MRV8
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- CS0: ChIPseq从入门到放弃
- CS1: ChIPseq简介
- CS2: BED文件
- CS3: peak注释
- CS4:关于ChIPseq注释的几个问题
- CS5: 吃着火锅,唱着歌,还把分析给做了
- CS6: ChIPseeker的可视化方法
- CS7:Genomic coordination的富集性分析(1)
- CS8:Genomic coordination的富集性分析(2)
- CS9: GEO数据挖掘
- CS10: 八卦终结版
- CS番外1:如何定义下游的区间?
- 富集分析
- clusterProfiler for enrichment analysis
- why clusterProfiler fails
- 为什么画出来的点比指定的数目要多?
- DAVID分析结果转为enrichResult
- DAVID functional analysis with clusterProfiler
- enrichDAVID支持自定义背景
- SCIENCE文章用了DAVID被吐槽
- Comparison of clusterProfiler and GSEA-P
- 听说你有RNAseq数据却不知道怎么跑GSEA
- leading edge analysis
- 单篇引用超过500了,来了解一下
- use clusterProfiler as an universal enrichment analysis tool
- 功能注释后如何做富集分
- msigdf + clusterProfiler全方位支持MSigDb
- 做学术终究是看脸...
- 富集分析事后丸:过滤数据
- buildGOmap
- 非模式基因GO富集分析:以玉米为例+使用OrgDb
- enrichGO出不来结果?没结果也是正确的结果
- GO analysis using clusterProfiler
- use simplify to remove redundancy of enriched GO terms
- GO富集分析中的间接注释
- 靠树树会倒,不要太相信你的注释文件!
- ko数据库ID转换
- 听说你的KEGG分析有大量的基因没注释
- 水稻如何做KEGG富集分析
- 使用新姿势玩KEGG,是种什么体验...
- 利用KEGG数据库进行ID转换
- KEGG Module Enrichment Analysis
- 搞大你的点,让我们画真正的气泡图
- 听说你也在画dotplot,但是我不服!
- dotplot展示富集分析结果
- dotplot for GSEA
- enrichment map
- joyplot:GSEA的结果也能快乐起来
- gseaplot自定义颜色
- DOSE包引用过百
- ggimage:ggplot2中愉快地使用图片
- geom_pokemon: 使用pokemon画图
- 大开眼界+多图慎点:Pokémon x NBA and other fun with ggimage
- 你的专业是那一只Pokémon神兽?
- 纯代码生成banner
- 我的名字和我的姓氏
- 正经的图千篇一律,不正经的叔万里挑一
- 饼图版气泡图
- 转发5个群,Y叔送你一顶帽子
- 用图片当ggplot2画布
- 2018世界杯专属图层
- 每周一图之粉丝来袭~
- ggimage的一波用户图秀
- 文章发表:两种方法在进化树上可视化数据
- Ask me anything about ggtree
- 当年ggtree发布文,为整合数据而生!
- ggtree无根树及注释
- ggtree画根分支
- phylip树格式
- ggtree版本的plotTree
- align genomic features with phylogenetic tree
- ggjoy facet with ggtree
- reproducible logo generated by ggtree
- phylomoji:用emoji画进化树
- 用ggtree重现Figtree的示例进化树
- ggtree for microbiome data
- ggtree for outbreak data
- 用户数据注释进化树
- 改变outgroup的枝长
- 使用自己的数据来给进化树上色
- bootstrap分段标记
- ggtree中标记树分支?
- xlim_tree: set x axis limits for only Tree panel
- reverse time scale
- vertical dendrogram in ggtree
- 中空的环形树
- 交互式操作进化树
- 可视化操作树的拓扑结构
- ggtree - updating a tree view
- facet_plot: 加图层到特定的分面上
- facet_plot:加图层到特定分面,方法二
- facet_plot: 关联数据和进化树的通用方法
- facet_plot更改panel label
- 漫画版的进化树你见过吗?
- 取子集画图
- Y叔不想养蛙,只想养你!
- 用图片注释进化树
- 交互式探索进化树
- 杀花,ggtree引用已经过百
- ggtree引用突破200
- ggnetworx:让ggtree支持phylogenetic networks
- ggtree买家秀
- 多个热图,多种配色,还要分开画图例?
- Introduction to ggplot2 and to ggtree
- Phylogenetic trees in R using ggtree
- Growing a ggtree
- Growing a ggtree - part 2, adding tip shapes
- Plotting a Sequential Binary Partition on a Tree in R
- 五彩进化树与热图更配-ggtree美颜进化树(宏基因组扩增子)
- Enhanced annotation of a primate phylogeny with ggtree
- using meshes for MeSH Enrichment Analysis
- 文章发表:Using meshes for MeSH term enrichment and semantic analyses
- 树变图,图变树?
- treeio: 进化树基础类和方法
- 进化树改名
- treeio: Phylogenetic data integration
- Subsetting Phylogenetic Trees
- Y叔的新玩意--yyplot
- 一次解决ggplot2所有字体
- 映射变量给axis上色
- pubmed年度趋势,你的开题报告需要它!
- ggplot扩展学习笔记--逐行解析Y叔的"geom_ord_ellipse.R"
- 轻松生成专属于你的二维码
- 怀疑人生!我不欠你们钱,好吗?
- 同一数据多变量分组的boxplot?
- 听说你还不会画热图
- 不同数据集画出的热图,用同样的颜色区间上色?
- ggplot2给选定的分面加背景
- 美化base plot
- 用par设置ggplot2参数?这个可以有!
- 花式打水印
- 用散点可视化一个矩阵
- 爆炸型的饼图
- 听说你还不会画动图
- ggplot2版本的维恩图
- 拟南芥富集分析
- 听说你想学R?
- 我在MSnbase里做了什么?
- 无中生有windows版R包
- 你所不知道的,R的N种打开方式
- R,python喊你回家吃饭啦
- VSCode里愉快地使用R
- R kernel in Jupyter notebook 3
- R的全新IDE
- 遇到这样的坑,那是相当的无助!
- R的诡异事件
- R里的赋值符号?
- 你的数据被化了妆?
- R总给我惊喜
- 听说你R脚本中的数据丢了,图出不来!
- 逼着老狗学新把戏
- R-3.5.0发布,又该升级了
- Windows用户如何无痛升级R
- 一个更好用的pheatmap
- 不用biocLite安装Bioconductor包
- 如何用bioconductor进行注释
- Bioconductor的注释包太旧怎么办?自己做呀
- 听说你画的图,线条不见了
- Newton-Raphson Method估算函数的根
- 用中值定理求根
- root finding - 4种演算法求函数的根
- 数值法求一重积分
- 使用蒙特-卡罗方法来估计Pi
- MC积分
- S3面向对象系统
- Single variable optimization
- 《R语言科学编程及仿真》读书笔记
- 食色性也
- R包辣鸡之CorMut
- 来自R的桌面提醒
- 有魔性的图来一发
- 用R画一只恐龙?
- basicTrendline:CRAN最新发布的线性非线性拟合的R函数包介绍
- clifun: 在R里装装逼
- Update R packages
- mathart:一个富有逼格的R包
- 用R玩一个小游戏吧!拖延症的老毛病又犯了!
- 你画的图有水果的味道,让我咬一口好吗!
- learn R wisdom with fortunes
- 画图?倒不如手绘吧!
- Use ggplot2
- ggplot2作图25招:《R入门25个菜谱》中所有图片的ggplot2版本
- 不需要花时间去学ggplot2主题系统
- 代码无感者的福音,小白也能ggplot2画出高大上的图
- ggplot2字体溢出的那点破事
- 根据GTF画基因的多个转录本结构
- 如何画类似MEME的注释序列
- Q-Q plot
- 邪恶的曲线
- 画一个印象派的蝙蝠吧
- 什么!你的图上有一双看不见的手
- 坑无处不在,以ggplot2的一个坑为例
- ggplot2设置可视化窗口
- ggplot2画图,文本太长了怎么办?
- 画图给点分组?
- 怎样用HOMER算出的P-value画出CNS级别的泡泡图?
- ggplot2 - 3.0.0版本的新功能
- ggplot label placement
- 图层中的统计量,你自己说的算!
- ggupset -- ggplot2版本的upset plot
- 按地理位置分面
- ggplot2分面之像素艺术
- ggridges:一种波涛汹涌,哦不对,是山峰叠峦的可视化方式
- 再见joyplot
- 一条指令把统计+画图都给做了?似乎太美好!
- 用ggplot2画3D
- ggplot2的3维画图时代
- Five things biologists should know about statistics
- 什么是T检验
- 富集基因之注释缺失
- 落入窠臼
- 你昨天才做的分析,可能是几年前的结果!
- 掐架的额外收获
- boxplot
- 如何告别单身
- 主成分分析
- 一文解决RT-PCR的统计分析
- TALEN基因编辑
- 生物实验的基本原理
- 纯文本可视化FASTQ质量数据
- a simple gene finder
- 搭建本地blast
- blast一大坑:无法输出query sequence title
- 简简单单讲insertion size
- pubmed停更?和你没半毛钱关系!你们是想放假想疯了吧?
- 实锤-PubMed没有停更
- 秒杀一切手工画通路的素材
- 我把Nature的Figure画成了蒙娜丽莎
- SIR Model of Epidemics
- s01 - Counting DNA Nucleotides
- s02 - Transcribing DNA into RNA
- s03 - Complementing a Strand of DNA
- s04 - Computing GC Content
- s05 - Finding a Motif in DNA
- s06 - Consensus and Profile
- s07 - Finding a Shared Motif
- s08 - RNA Splicing
- 如何获取文献
- 在这个看脸(哦不对,看图)的时代,做科研的你怎么能错过这个帮你找一张漂亮脸蛋的神器!
- 什么?听说你有文章却不知道该往那里投!
- 听说你也在读文献
- 什么?杂志要求图片要300dpi的TIFF,还限制了文件大小,臣妾做不到啊
- csvtk - 跨平台、高效、实用的CSV/TSV命令行工具
- bioSyntax:针对生物数据的语法高亮
- bioView - 一个生信常用文件格式的可读性增强工具
- sci-hub如果挂了,你还有神器下文献吗?
- 再不用担心打不开sci-hub了
- 2018最新可用的sci-hub镜像+桌面版程序
- 独家:SciHub苹果桌面版
- 关于scihub,一文就够了
- 一图告诉你sci-hub有多美好!
- Sci-Hub可用域名实时追踪
- Kopernio: 快速一键下文献
- 十年前截屏
- 软件更新大法
- scau校园网认证
- realvnc:各种设备互联
- 合体中的操作系统
- 酗酒的Linux不是好企鹅
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- elementaryOS: 2018最美Linux
- ubuntu安装只有redhat版本的454分析软件
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- 度娘才是最大的老司机
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- 你们想要的:QQ跑在Linux上
- 飞天猫:长着蝙蝠翅膀的猫!
- gotop:一个更有逼格的top
- Using Linked List to solve Josephus problem
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- 中值法求函数值
- 金银岛航线
- 利用多边形估计Pi值
- 斐波那契数列
- Neumann的随机数生成器
- Linear Congruential Generator
- 博士版2048,不服来战!
- 滚吧,骚年
- 扫盲贴:博士学位知多少
- 给硕博考生的一封信
- 牛逼的博士论文,标题只有两个字符!
- #聚众读博# Y叔招生信方向的硕士、博士、博士后
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- 港校申请指北:考研考博失利之后的另一选择
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- 粪便上的头像,悄咪咪地不见了!
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- 从业超过10年,未见过如此厚颜无耻之人
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- 关于重用代码与文章抄袭
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- 虽然撤稿了,但足以令人心寒!
- 撒花,1万粉了
- 为什么要开这个公众号
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